本发明公开了一种基于蜂巢芯片的检测棘球蚴不同虫种的检测试剂盒,其用于同时检测细粒棘球蚴病和多房棘球蚴病,共计2种虫株。该试剂盒包括如下引物:细粒棘球蚴引物,4条,SEQ ID NO.1‑4;多房棘球蚴引物,4条,SEQ ID NO.5‑8。此外本发明还公开了一种基于蜂巢芯片的检测棘球蚴不同虫种的方法。本发明通过各种验证表明本发明具有快速、敏感、特异性强的特点,解决了基层没有PCR仪检测和电泳的繁琐步骤,一次反应可以达到同时检测多个基因,明确虫种的虫种,大大减轻了工作量,缩短了检测时间,降低了检测成本