本发明提供了一种提高金银花中木犀草素含量的重组基因及其应用,涉及基因工程领域,本发明提供一种提高金银花中木犀草素含量的重组基因及其应用,所述重组基因的核苷酸序列如SEQ ID No 2所示。本发明还提供一种提高金银花中木犀草素含量的方法,所述方法包括:构建重组质粒,所述重组质粒包含核苷酸序列如SEQ ID No 2所示的重组基因;采用农杆菌介导法将重组质粒转入到金银花叶片中,进行培养,获得目的植株将含有目的基因的重组质粒在金银花中表达,能够明显提高金银花叶片中木犀草素含量,现对于未处理的金银花,使得金银花叶片中木犀草素含量提高了109.7%。