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[发明专利]一种基于基因表达谱的胃癌预后标志物筛选及分类方法-CN201610856566.3在审
发明人：祝让飞 -专利权人：牟合（上海）生物科技有限公司
申请日： 2016-09-27 - 公布日： 2017-02-15 - 主分类号： G06F19/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于基因表达谱的胃癌预后标志物筛选及分类方法，包括基因表达谱数据筛选出表达有变化的基因，针对筛选基因建立Cox比例风险模型分析，选取具有统计学显著性的基因作为种子基因，结合病人的临床随访信息数据构建最大似然模型筛选预后关键基因本发明能够有效的将高维冗杂的基因表达谱数据降维，从几万个基因中筛选出容易应用于临床检测的关键的几个基因，并通过关键的几个基因的表达情况预测病人的生存和复发风险。
一种基于基因表达胃癌预后标志筛选分类方法

[发明专利]一种单细胞转录组Pseudo-Cell分析方法、模型及存储介质和设备-CN202211523697.1有效
发明人：胡超;胡龙飞 -专利权人：新格元（南京）生物科技有限公司
申请日： 2022-12-01 - 公布日： 2023-05-26 - 主分类号： G16B35/00 文献下载
摘要：所述方法包括以下步骤：（1）基于单细胞表达矩阵构建细胞与细胞之间基于表达谱高维空间距离的关系矩阵，通过关系矩阵分析细胞之间的相似性；（2）通过社区发现算法基于所述细胞之间的相似性划分为不同的子细胞群；（3）基于步骤（2）得到的细胞分群信息，整合每个子细胞群内部的表达谱，得到新整合的表达谱矩阵。本发明通过在划分细胞分群关系的社区发现算法中引入社区规模限制参数以及高分辨率下迭代分群的思路，将表达相似性最高的细胞分群整合为Pseudo‑Cell，解决了在单细胞数据中广泛存在的以dropout为主的数据噪音问题
一种单细胞转录 pseudo cell 分析方法模型存储介质设备

[发明专利]早期肺腺癌miRNA特异表达谱及其反转录引物和用途-CN201310049265.6无效
发明人：娄加陶;薛剑;王琳;吴传勇 -专利权人：上海市胸科医院
申请日： 2013-02-07 - 公布日： 2013-06-26 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：本发明属于生物学和医学检验领域，涉及一种肿瘤生物标志物，具体涉及一种早期肺腺癌miRNA特异表达谱及其反转录引物和用途。所述早期肺腺癌miRNA特异表达谱包括上调表达的miR-103、miR-146a、miR-151、miR-221、miR-222和miR-223中的一种以上。基于以上特异表达谱提供了早期肺腺癌诊断模型、特异表达miRNA的反转录引物和用于早期肺腺癌诊断用试剂盒或生物芯片。
早期腺癌 mirna 特异表达及其转录引物用途

[发明专利]对在人类血清中指示人类肺组织的病理学状态的蛋白质的鉴定-CN200880113342.7无效
发明人： R·T·斯特里佩;E·伊兹比卡;S·H·贝克 -专利权人：癌症预防和治疗有限公司
申请日： 2008-09-11 - 公布日： 2010-09-15 - 主分类号： G01N27/00 文献下载
摘要：鉴定在人类血清中存在的蛋白质的方法，所述蛋白质在正常个体和按照医生诊断已知患有非小细胞肺癌和哮喘的患者之间差异地表达。比较来自各个群体的质谱数据以确定具有在正常、哮喘和肺癌群体之间显著差异地表达的表达强度的蛋白质。发现11种蛋白质具有在所述群体之间显著差异地表达的表达强度。最后，通过将所述质谱数据与具有已知蛋白质的质谱数据文库的已知数据库比较，获得11种蛋白质的特征。
人类血清指示组织病理学状态蛋白质鉴定

[发明专利]一种lncRNA鉴定和表达定量的分析方法-CN201911381879.8有效
发明人：沈立;孙子奎 -专利权人：上海派森诺生物科技股份有限公司
申请日： 2019-12-27 - 公布日： 2023-03-14 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种lncRNA鉴定和表达定量的分析方法，其特征在于，包括一系列的测序数据过滤步骤、测序数据比对步骤、转录拼接步骤、基因比对步骤、lncRNA过滤步骤以及lncRNA分析步骤。
一种 lncrna 鉴定表达定量分析方法

[发明专利]I型干扰素诊断-CN201080044756.6无效
发明人： B·希格斯;朱蔚;C·莫尔豪斯;B·怀特;B·加莱;Y·姚 -专利权人：米迪缪尼有限公司
申请日： 2010-09-02 - 公布日： 2012-10-24 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明包括I型IFN和IFNα诱导的PD标记物表达谱、用于鉴定此类IFNα诱导的PD标记物表达谱的试剂盒和方法。所述I型IFN和IFNα诱导的PD标记物表达谱也可用于(例如)治疗患有I型IFN和IFNα-介导的疾病的患者的方法、监测接受利用调节1型干扰素活性的治疗剂治疗的患者的疾病进展的方法、将患者鉴定为接受结合和中和
干扰素诊断

[发明专利]一种自适应波浪谱形参数化方法-CN202210213189.7有效
发明人：孙泽;刘小龙;蔡志文;丁军;陈文炜 -专利权人：中国船舶科学研究中心
申请日： 2022-03-04 - 公布日： 2023-05-30 - 主分类号： G06F18/213 文献下载
摘要：本发明公开了一种自适应波浪谱形参数化方法，涉及海洋工程技术领域，该方法包括：采集观测点的波浪数据，以原始波浪能周期对应的频率作为分割点，从波浪数据的原始频谱中寻找分割点将整个频谱划分成第一谱区和第二谱区；分别计算每个谱区的波浪谱矩；根据波浪谱矩计算归一化后的双峰因子和风涌系数；双峰因子用于表达波浪谱形的峰形，风涌系数用于表达波浪谱形介于风浪和涌浪之间的平衡关系；以双峰因子和风涌系数为轴建立二维谱形空间，根据计算得到的双峰因子和风涌系数在二维谱形空间的位置确定波浪数据的波浪谱形。该方法利用双峰因子和风涌系数来量化波浪谱形的变化，适合于工程中实测波浪数据的处理和波浪结构响应计算中波浪谱形的确定。
一种自适应波浪参数方法

[发明专利]一种基于图挖掘技术的基因表达模块发现方法-CN202110154318.5在审
发明人：王建东;黄致远;夏翔;袁思林;刘振宇;胡欣立 -专利权人：西安电子科技大学青岛计算技术研究院;西安电子科技大学;西电科大（青岛）计算技术研究院有限公司
申请日： 2021-02-04 - 公布日： 2022-08-05 - 主分类号： G16B40/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于图挖掘技术的基因表达模块发现方法，包括经典聚类算法:MCL聚类算法，谱聚类算法，亲和传播聚类算法。本发明基于图的聚类算法，针对基因数据，将基因共表达关系建模为一个图，从而将聚类问题转化为图划分问题。通过研究基因来发现基因与疾病之间的联系，更好地了解相关疾病。分析大型全基因组基因表达数据集的关键步骤是使用模块检测方法将基因分组为共表达模块，而经典聚类算法作为大型基因表达谱检测的重要工具，在对基因数据集的研究中起着巨大作用。本发明采用Python工具包，在真实基因表达谱数据上进行了仿真实验，为生物信息学领域检测生物功能模块提供了一个有效的计算工具。
一种基于挖掘技术基因表达模块发现方法

[发明专利]一种部分相干高斯光束辐照度波动时间特性的确定方法-CN202010514883.3有效
发明人：王平;顾士忠;邹正兴;宋晓慧 -专利权人：西安电子科技大学
申请日： 2020-06-08 - 公布日： 2021-04-30 - 主分类号： G01J1/42 文献下载
摘要：本发明公开了一种部分相干高斯光束辐照度波动时间特性的确定方法，确定部分相干高斯光类型及海水中的功率谱密度表达式；基于泰勒“冻结”假设，得到时间协方差函数表达式；通过时间协方差函数表达式，得出时间相关系数，并利用三角函数，超几何函数和拉盖尔积分公式化简，得到近似表达式；得出辐照度波动的瞬时功率谱表达式；利用超几何函数和拉盖尔积分公式进行化简，得出辐照度瞬时功率谱的近似表达式；通过改变部分相干光参数和海水特征参数，研究对部分相干高斯光束在海洋弱湍流中辐照度的瞬时功率谱的影响。
一种部分相干光束辐照波动时间特性确定方法

[发明专利]一种人体免疫力定量评估系统-CN202110987443.4在审
发明人：何斯荣;王建为;李胜龙 -专利权人：重庆医科大学
申请日： 2021-08-26 - 公布日： 2021-12-21 - 主分类号： C12Q1/6883 文献下载
摘要：本发明公开了一种人体免疫力定量评估系统，包括血液处理单元，用于从人外周血中分离得到免疫细胞；基因提取单元，用于提取总RNA；测序单元，用于对所提取的RNA进行高通量测序，得到基因表达的图谱；免疫评估单元，用于对基因表达进行加权评分计算，输出免疫力得分。
一种人体免疫力定量评估系统

[发明专利]特发性肺纤维化病诊断标志物及其应用-CN202211445006.0在审
发明人：孙宝清;孙世学;郑佩燕;薛明汕;黄惠敏;罗文婷;程章恺 -专利权人：广州医科大学附属第一医院（广州呼吸中心）
申请日： 2022-11-18 - 公布日： 2023-02-03 - 主分类号： C12Q1/6883 文献下载
摘要：本发明对特发性肺纤维化(IFP)肺组织进行第三代单分子RNA实时测序和第二代RNA测序，首次发现转录本ENST00000529044的表达水平在IFP肺组织和正常肺组织中的表达水平存在显著差异，通过对血液等样本中的转录本
特发性肺纤维化诊断标志及其应用

[发明专利]一种检测奥尼罗非鱼IGF-1等位基因表达的方法及其试剂盒-CN201811107882.6有效
发明人：钟欢;周毅;罗永巨;肖俊;张孝瑾;韩卓君;于凡;郑惠芳;唐瞻杨;郭忠宝 -专利权人：广西壮族自治区水产科学研究院
申请日： 2018-09-21 - 公布日： 2021-07-16 - 主分类号： C12Q1/6888 文献下载
摘要：本发明公开了一种检测奥尼罗非鱼IGF‑1等位基因表达的方法及其试剂盒，属于生物化学与分子生物学领域。本发明的检测方法包括(1)RNA逆转录；(2)PCR扩增；(3)焦磷酸测序反应。本发明的试剂盒包括PCR扩增的特异性引物和焦磷酸测序引物。本发明的方法可实时监测反应并且定量、快速检测，具有特异性强等优点，为简便、快速地检测奥尼罗非鱼IGF‑1等位基因表达带来便利，而且检测成本低。
一种检测罗非鱼 igf 等位基因表达方法及其试剂盒

[发明专利]一种基因信息的量子隐形测序方法-CN202110695546.3在审
发明人：万继华 -专利权人：万继华
申请日： 2021-06-23 - 公布日： 2022-12-23 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明涉及生物信息领域，具体说是一种基因信息的量子隐形测序方法，该测序方法是根据碱基分子与量子华特模型的信息相对应的关系形成的，并通过将未知RNA制备到量子拓扑体芯上，然后，启动RNA的信息表达，并依次以量子华特为单位读取并记录信号；再按碱基分子与量子华特模型的信息相对应关系，分别以碱基分子名称表示基因信息的序列，解决了以量子隐形方法对基因测序技术问题。
一种基因信息量子隐形方法

[发明专利]一种对高通量RNA测序数据的质量控制方法及装置-CN201410409210.6在审
发明人：郁颖;庆涛;赵琛;杜婷婷;郑媛婷;石乐明 -专利权人：复旦大学
申请日： 2014-08-19 - 公布日： 2016-02-24 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明属于高通量RNA测序技术领域，公开了一种通过加入外源参照物对高通量RNA测序数据进行质量评估和质量控制的方法，其包括：系统评估外源参照序列在测定样品中的比例、定量水平、基因覆盖度及测序错误率等特征本发明还公开了一种对高通量测序进行质量控制的装置，包括：基因表达测算单元、相关性分析单元、基因覆盖度分析单元和碱基错误率分析单元。本发明可以针对RNA质量、转录组测序实验过程及数据分析流程等多个环节进行质量控制，从而大幅提高高通量测序数据的可靠性和可重复性。
一种通量 rna 序数质量控制方法装置

[发明专利]基于Nanopore测序技术的多组学测序及分析方法-CN201910048654.4在审
发明人：王军;赵娜;陈亮;徐嘉悦;于莹;李亦嘉;徐西占;许亚昆 -专利权人：中国科学院微生物研究所
申请日： 2019-01-18 - 公布日： 2020-07-28 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明提供一种基于Nanopore测序技术的多组学测序及分析方法，包括：A、将采集的样本同时进行DNA和RNA提取；B、提取的RNA 3′端添加Poly U尾巴；C、将带有Poly U尾巴的RNA反转录成cDNA，并在其5′端添加MID条形码序列；D、将cDNA样品与DNA样品混合建库，进行Nanopore测序；E、将测序数据中所有cDNA表达量水平按照DNA进行均一化处理；F、对测序数据中全基因组甲基化信号进行读取与分析本发明在实现基因组测序的基础上，同时还能够实现转录组以及表观甲基化组检测，并达到宏转录组、宏基因组以及表观甲基化组的多组学关联分析的目的。
基于 nanopore 技术多组学测序分析方法