本发明提供了一种拟穴青蟹致敏蛋白的编码基因及其应用,该致敏蛋白的编码基因由SEQ ID NO:1的核苷酸序列构成。本发明还公开了含有该基因的表达载体、重组菌株;制备该致敏蛋白的方法以及该致敏蛋白的应用。根据本发明的拟穴青蟹致敏蛋白的编码基因,其克隆入原核表达载体,构建重组表达质粒,再转入宿主菌并诱导表达,可获得拟穴青蟹致敏蛋白rScy p 9,利用该拟穴青蟹致敏蛋白rScy p 9与甲壳类过敏患者血清进行IgE结合能力的测定,可为过敏症状的临床诊断及致敏原详细筛查提供参考依据,使得针对Scy p 9的过敏性疾病的防控和治疗及时准确。