本发明公开了一个A型肉毒毒素受体结合区Hc基因及其编码蛋白与应用。其目的是提供一个A型肉毒毒素受体结合区Hc基因及其编码蛋白与其在制备A型肉毒毒素疫苗中的应用。该基因是下述核苷酸序列之一:1)序列表中SEQ ID NO:1的DNA序列;2)编码序列表中SEQ ID NO:2的DNA序列;3)与序列表中SEQ ID NO:1限定的DNA序列具有90%以上同源性且具有激发机体对A型肉毒毒素产生免疫保护作用的核苷酸序列本发明的A型肉毒毒素受体结合区Hc基因及其编码蛋白将在制备A型肉毒毒素疫苗中发挥重要作用,应用前景广阔。