本发明公开了一种紫花苜蓿MYB转录因子及编码基因和应用，涉及生物技术领域，该MYB转录因子基因核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；公开了该基因的植物过表达载体和RNA干扰表达载体；公开了该基因、植物过表达载体和RNA干扰表达载体在紫花苜蓿中类黄酮代谢调控或/和叶片发育中的应用。本发明克隆了一个参与紫花苜蓿类黄酮代谢调控或掌状复叶形成的MsMYB206转录因子基因，研究该基因在紫花苜蓿中的表达模式，比较了野生型、转MsMYB206基因紫花苜蓿总黄酮含量及叶片形态，能够应用于培育出每片叶子有更多小叶的品种，提高栽培苜蓿的叶茎比，从而提高其产量和营养价值。
本发明公开了一种由紫花苜蓿γ-生育酚甲基转移酶基因编码的蛋白，其中，该蛋白具有SEQ ID No：2所示的氨基酸序列，或者该蛋白具有将SEQ ID No：2所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代本发明还涉及该蛋白的编码基因，以及含有该基因的表达载体和细胞，同时还涉及一种培育α-生育酚含量高的紫花苜蓿的方法和它们的应用。本发明提供的紫花苜蓿γ-生育酚甲基转移酶基因(MSTMT)在紫花苜蓿中的表达可以显著提高紫花苜蓿中α-生育酚的含量。该基因的发现为提高主要牧草植物(特别是豆科植物，如紫花苜蓿)中α-生育酚的含量提供了基因资源，在基因工程改良牧草的研究中将发挥重要作用。
本发明提供紫花苜蓿基因MsCYP20‑3B及应用。本发明提供的基因MsCYP20‑3B能够有效改良紫花苜蓿开花时间。基因MsCYP20‑3B及其编码蛋白的序列分别如SEQ ID NO:1和2所示。通过对该基因的应用进一步明确了其在调控苜蓿开花时间中的分子机理，对培育苜蓿早熟品种具有重要的指导意义，有利于改良紫花苜蓿的品质。
