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[发明专利]一种药物基因组学知识图谱构建方法及系统-CN201811056554.8在审
发明人：李姣;侯丽;康宏宇 -专利权人：中国医学科学院医学信息研究所
申请日： 2018-09-11 - 公布日： 2019-02-01 - 主分类号： G06F16/36 文献下载
摘要：本发明公开了一种药物基因组学知识图谱构建方法及系统，该方法包括：获取与药物基因组学相匹配的初始数据信息；对所述初始数据信息进行数据抽取处理，获得目标数据信息；根据所述目标数据信息，确定分析维度以及所述分析维度之间的关联关系；基于所述分析维度和所述分析维度之间的关联关系，构建获得初始药物基因组学知识图谱；对所述初始药物基因组学知识图谱进行验证，获得目标药物基因组学知识图谱。通过本发明实现了基于药物基因组学指导精准用药，提高药物疗效的目的。
药物基因组学分析维度图谱初始数据信息目标数据信息关联关系图谱构建基因组学目标药物数据抽取药物疗效构建匹配验证

[发明专利]一种基于影像基因组学的新辅助化疗疗效预测方法及系统-CN202211417630.X在审
发明人：尹晓霞;张彦春;王伟彤;高明勇;叶国麟;殷丽华 -专利权人：广州大学
申请日： 2022-11-11 - 公布日： 2023-01-24 - 主分类号： G16H50/20 文献下载
摘要：本发明提供了一种基于影像基因组学的新辅助化疗疗效预测方法及系统，所述方法包括：获取术前采用新辅助化疗患者的外泌体基因组学样本和对应的动态磁共振乳腺影像；将动态磁共振乳腺影像分别输入预设影像组学特征提取模型和预设卷积神经网络模型，得到对应的影像组学特征和影像分子分型特征；对外泌体基因组学样本进行转录组测序，得到基因组学特征；将影像组学特征、影像分子分型特征和基因组学特征输入预设双向门限循环神经网络模型进行疗效预测，得到疗效预测结果本发明方法实现高维非结构化影像数据与高特异结构化基因组学数据的有效融合，高效精准挖掘全面有用的特征信息，有效提升自动化预测新辅助化疗效的准确性。
一种基于影像基因组辅助化疗疗效预测方法系统

[发明专利]一种基因组学数据管理方法、服务器和系统-CN201710716468.4在审
发明人：不公告发明人 -专利权人：为朔医学数据科技(北京)有限公司;为朔生物医学有限公司
申请日： 2017-08-21 - 公布日： 2017-12-22 - 主分类号： G06F19/18 文献下载
摘要：本发明提供了一种基因组学数据管理方法、服务器和系统，该方法包括获取信息采集终端输入的受检者的基因组学数据；对基因组学数据按照预设的加密规则进行加密处理得到加密后的数据，并存储该加密后的数据；获取受检者的基本信息和加密后的数据存储的物理位置信息，基于基本信息和加密后的数据存储的物理位置信息生成该受检者所对应的身份标识；将身份标识存储至身份标识数据库；将身份标识发送至受检者所对应的终端，以使受检者可以通过使用所述身份标识进行获取该受检者的基因组学数据或者用药安全风险评估报告；该方法对受检者的基因组学数据进行统一管理，数据可以被重复使用，进而可以提高基因组学数据的安全性。
一种基因组数据管理方法服务器系统

[发明专利]高通量单细胞多组学-CN201880011470.4在审
发明人： R·范;B·杜拉 -专利权人：耶鲁大学
申请日： 2018-02-13 - 公布日： 2019-11-29 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：在一些实施方式中，本文提供了用于高通量单细胞多组学(例如，基因组学、表观基因组学、蛋白质组学和/或表型谱)分析的装置、系统和方法。
基因组学蛋白质组学表型谱高通量组学分析

[发明专利]适合中国人群华法林个体化抗凝的药物基因组学检测试剂盒-CN201210003997.7有效
发明人：尹彤;许强 -专利权人：尹彤
申请日： 2012-01-06 - 公布日： 2012-07-04 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明提供一种适合中国人群华法林个体化抗凝的药物基因组学检测试剂盒，其主要包含CYP2C9、VKORC1和CYP4F2相关基因型的扩增引物，CYP2C9、VKORC1和CYP4F2相关基因型的测序引物，还可以包含用以说明适合中国人群的华法林药物基因组学剂量预测模型的说明书或/和记录有中国人群的华法林药物基因组学剂量预测模型的计算机可读存储介质。本发明的华法林药物基因组学检测试剂盒，制备简单、使用方便；采用该试剂盒，通过检测华法林药物基因组学指标，整合临床环境因素，利用本发明建立的适合中国人群的华法林药物基因组学剂量预测模型软件，能够准确的估计中国患者人群的华法林抗凝治疗剂量
适合中国人群华法林个体化抗凝药物基因组检测试剂盒

[发明专利]一种尖锄蚌F型线粒体基因组全序列扩增的方法-CN201610910964.9在审
发明人：周春花;黄晓晨;吴小平;欧阳珊 -专利权人：南昌大学
申请日： 2016-10-20 - 公布日： 2017-03-15 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：一种尖锄蚌F型线粒体基因组全序列的扩增方法，包括基因组DNA提取、普通PCR扩增及测序、设计长片段引物、LA‑PCR扩增及测序、序列拼接和基因注释。本发明获得了尖锄蚌F型线粒体基因组全序列，为尖锄蚌的种类鉴定、蚌科的系统发生学、比较和进化基因组学、谱系基因组学、种质资源保护、可持续和合理地利用奠定提供重要的基础材料。
一种尖锄蚌线粒体基因组序列扩增方法

[发明专利]一种橄榄蛏蚌M型线粒体基因组全序列扩增的方法-CN201610911001.0在审
发明人：周春花;黄晓晨;吴小平;欧阳珊 -专利权人：南昌大学
申请日： 2016-10-20 - 公布日： 2017-03-15 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：一种橄榄蛏蚌M型线粒体基因组全序列扩增的方法，包括基因组DNA取、普通PCR扩增及测序、设计长片段引物、LA‑PCR扩增及测序、序列拼接和基因注释。本发明获得了橄榄蛏蚌M型线粒体基因组全序列，为橄榄蛏蚌的种类鉴定、蚌科的系统发生学、比较和进化基因组学、谱系基因组学、种质资源保护、可持续和合理地利用奠定提供重要的基础材料。
一种橄榄线粒体基因组序列扩增方法

[发明专利]一种河蛏蚌F型线粒体基因组全序列扩增的方法-CN201610910960.0在审
发明人：欧阳珊;黄晓晨;吴小平;周春花 -专利权人：南昌大学
申请日： 2016-10-20 - 公布日： 2017-03-08 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：一种河蛏蚌F型线粒体基因组全序列扩增的方法，包括基因组DNA提取、普通PCR扩增及测序、设计长片段引物、LA‑PCR扩增及测序、序列拼接和基因注释。本发明获得了河蛏蚌F型线粒体基因组全序列，为河蛏蚌的种类鉴定、蚌科的系统发生学、比较和进化基因组学、谱系基因组学、种质资源保护、可持续和合理地利用奠定提供重要的基础材料。
一种河蛏蚌线粒体基因组序列扩增方法

[发明专利]一种河蛏蚌M型线粒体基因组全序列扩增的方法-CN201610910965.3在审
发明人：周春花;黄晓晨;吴小平;欧阳珊 -专利权人：南昌大学
申请日： 2016-10-20 - 公布日： 2017-01-11 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：一种河蛏蚌M型线粒体基因组全序列扩增的方法，包括基因组DNA提取、普通PCR扩增及测序、设计长片段引物、LA‑PCR扩增及测序、序列拼接和基因注释。本发明获得了河蛏蚌M型线粒体基因组全序列，为河蛏蚌的种类鉴定、蚌科的系统发生学、比较和进化基因组学、谱系基因组学、种质资源保护、可持续和合理地利用奠定提供重要的基础材料。
一种河蛏蚌线粒体基因组序列扩增方法

[发明专利]一种16S和宏基因组测序数据关联分析方法、系统及设备-CN202011555939.6有效
发明人：高川;周煌凯;陈飞钦;艾鹏;张秋雪 -专利权人：广州基迪奥生物科技有限公司
申请日： 2020-12-24 - 公布日： 2023-03-03 - 主分类号： G16B10/00 文献下载
摘要：本发明是关于一种16S和宏基因组测序数据关联分析方法、系统及设备。该方案包括对样本进行16S测序和宏基因测序，获取16S组学数据和宏基因组学数据；根据所述16S组学数据进行microPITA分析，获得代表性样本；根据所述16S组学数据和所述宏基因组学数据进行韦恩分析，获得共有和特有统计物种/功能统计，并图示化展示；进行物种/功能分布分析，获得两组学所有样本中物种/功能丰度变化和主要物种/功能类型；根据所述16S组学数据和所述宏基因组学数据进行相关性分析和环境因子关联分析该方案提供16S与宏基因组测序数据关联分析方法，利用宏基因组扩展数据研究深度，利用16S验证宏基因组数据分析准确性，实现两组学数据的相互补充和验证。
一种 16 宏基序数关联分析方法系统设备

[发明专利]用于从单细胞基因组学数据集中对细胞进行子采样的方法和系统-CN202180062493.X在审
发明人：帕拉沙·达珀拉;戈兰·卡尔森 -专利权人：尼根分析有限公司
申请日： 2021-09-15 - 公布日： 2023-05-23 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本公开涉及一种从单细胞基因组学数据集中的多个细胞中提取细胞的子样品的计算机实现的方法，该方法包括以下步骤：获得以至少两个维度表示的单细胞基因组学数据集，其中关于每个细胞的信息以第一维度表示，并且关于基因组学特征的信息以第二维度表示；从该单细胞基因组学数据集生成细胞‑细胞邻域图，该细胞‑细胞邻域图提供关于该细胞的该基因组学特征的相似性的信息，其中该细胞被表示为该细胞‑细胞邻域图中的顶点；将该细胞‑细胞邻域图中的该细胞划分为种子细胞和非种子细胞本公开还涉及一种用于从单细胞基因组学数据集中的多个细胞中提取细胞的子样品的计算机系统。
用于单细胞基因组数据集中细胞进行采样方法系统

[发明专利]基于基因组学和微生物组学的遗传性胃癌评估方法及系统-CN202211720285.7在审
发明人：沈成国;许峥;许娟;史文钊 -专利权人：神州医疗科技股份有限公司
申请日： 2022-12-30 - 公布日： 2023-02-03 - 主分类号： G16H50/30 文献下载
摘要：本发明涉及基因分析技术领域，具体为一种基于基因组学和微生物组学的遗传性胃癌评估方法及系统，本发明方法包括：获取遗传性胃癌患者的数据，遗传性胃癌患者的数据包括患者的微生物组学、基因组学、表观基因组学、代谢组学将遗传性胃癌患者的数据分为训练集和测试集并进行预处理，构建基于AdaBoost算法优化的BP神经网络的预测模型，通过训练集对预测模型进行训练，通过测试集对预测模型进行验证，通过预测模型对人患胃癌进行评估；本发明通过患者的基因组学和微生物组学数据
基于基因组微生物遗传性胃癌评估方法系统

[发明专利]毒理基因组学指数预警饮用水源水致癌风险的方法-CN201210235805.5无效
发明人：程树培;张宴;吴兵;陈亚军;张徐祥;李梅;崔益斌;李爱民;顾继东;福得;史薇;韦斯;刘苏;尹金宝;施鹏;赵福正;黄开龙;张宗尧;贾舒宇;王铸 -专利权人：南京大学
申请日： 2012-07-09 - 公布日： 2012-10-24 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：毒理基因组学指数（crTGI）预警饮用水源水致癌风险的方法，步骤如下：（1）应用基因芯片，检测水源水对小鼠的涉癌毒理基因组学指数（crTGIs），指示水样中所有污染物潜在的致癌毒性；（2）以强致癌污染物苯并芘（BaP）为阳性毒性对照，将水源水涉癌毒理基因组学指数（crTGIs）数值，转化为BaP毒性的当量浓度；根据美国EPA控制BaP对人体致癌风险的标准阈值浓度，评价水源水BaP当量浓度的致癌风险度。
基因组指数预警饮用水源致癌风险方法

[发明专利]用于重建药物应答和疾病网络的方法和系统以及其用途-CN202080015935.0在审
发明人： B·D·阿西;G·A·希金斯;A·艾德;A·卡利宁;N·里马鲁恩;J·S·伯恩斯 -专利权人：密歇根大学董事会
申请日： 2020-01-22 - 公布日： 2021-11-02 - 主分类号： G16H20/10 文献下载
摘要：描述了包括重建药物特异性药物基因组学网络和其组成功能子网络的集成的、多尺度的、基于人工智能的系统的方法。所述系统使用染色质空间中的药物调制的空间接触的三维架构的功能拓扑的特征。药物药物基因组学网络的发现是通过以下进行的：借助于插补来选择候选SNP、使用机器学习和深度学习来确定所述SNP的预测因果关系、使用因果关系SNP来探测如通过染色体构象捕获分析确定的空间基因组、将由同一细胞以及组织特异性增强子控制的靶向基因组合以及基于全基因组关联研究的结果使用不同数据源和度量来重建药物基因组学网络使用基于知识的分段方法来将所述药物基因组学网络解构为其组成功效和不良事件子网络，以用于应用于临床决策支持、药物再利用和硅中药物发现中。
用于重建药物应答疾病网络方法系统及其用途

[发明专利]通过扩展显微法的蛋白质和核酸的纳米级成像-CN201680058184.4有效
发明人： A·瓦西;F·陈;E·S·博伊登;S·阿龙;E·道格哈尔西;G·丘奇 -专利权人：麻省理工学院;哈佛学院董事会
申请日： 2016-08-05 - 公布日： 2021-07-23 - 主分类号： C12Q1/6841 文献下载
摘要：本发明使得能够在已经物理扩展的生物样本中进行核酸的原位基因组学和转录组学评估。本发明利用扩展显微(ExM)技术以便在本文中称为“扩展荧光原位杂交”(ExFISH)的新过程中提供用于核酸的原位基因组学和转录组学评估的新方法。
通过扩展显微蛋白质核酸纳米成像

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