[发明专利]基于互近邻的单细胞转录组批次矫正方法在审
| 申请号： | 202310372606.7 | 申请日： | 2023-04-10 |
| 公开（公告）号： | CN116312792A | 公开（公告）日： | 2023-06-23 |
| 发明（设计）人： | 高琳;梁涛;许晗;胡宇轩 | 申请（专利权）人： | 西安电子科技大学 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00;G16B40/00;G06N3/0455;G06N3/08 |
| 代理公司： | 陕西电子工业专利中心 61205 | 代理人： | 王品华 |
| 地址： | 710071 陕*** | 国省代码： | 陕西;61 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于互近邻单细胞转录组批次矫正方法，主要解决现有基于互近邻批次矫正方搜索到的MNN对数量少，矫正效果差的问题。其实现方案为：对单细胞转录组数据的基因特征进行筛选，筛选出高表达的基因；构建由编码器和解码器组成的自编码器，使用单细胞转录组数据筛选出高表达的基因对该编码器与解码器进行交叉训练；使用训练好的自编码器提取单细胞转录组数据筛选出高表达基因的特征，获得单细胞低维嵌入无批次信息数据；在单细胞低维嵌入无批次信息数据中搜索互近邻对，并利用其计算出一个矫正向量；使用矫正向量对数据进行批次矫正；本发明搜索到的MNN对多，批次矫正效果好，可用于生物信息学实验中对单细胞转录组数据的预处理。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 近邻 单细胞 转录 批次 矫正 方法 | ||
【主权项】：
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