[发明专利]酶-底物亲和力常数预测方法、存储介质和装置有效

专利信息
申请号: 202310206869.0 申请日: 2023-03-07
公开(公告)号: CN116417062B 公开(公告)日: 2023-09-15
发明(设计)人: 魏志强;刘其琛;刘昊;毛相朝;李阳阳;刘成超 申请(专利权)人: 中国海洋大学
主分类号: G16B15/30 分类号: G16B15/30;G16B30/00;G06F18/214;G06N3/0464;G06N3/08
代理公司: 长沙准星专利代理事务所(普通合伙) 43241 代理人: 白甲坡
地址: 266100 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要: 发明涉及一种酶‑底物亲和力常数预测方法、存储介质和装置,属于生物信息学领域,所述方法包括如下步骤:1)构建蛋白质和化合物序列语料库用来训练模型,2)提取表征底物信息的复合SMILES字符串和表征酶信息的氨基酸序列嵌入模型,构建张量矩阵,3)将张量矩阵输入到卷积神经网络进行特征提取,获得特征向量;4)将提取到的两个特征向量连接成单个向量,并将该向量输入到回归网络中以进行KM预测。本发明还提供了存储有所述方法的计算机可读存储介质和由所述介质组成的装置。本发明可以将蛋白质序列和底物的SMILES字符串的上下文信息进行相关表示,可以表征各种序列或字符串中每个氨基酸或原子的多样性,从而提高酶‑底物亲和力常数KM预测的准确性。
搜索关键词: 亲和力 常数 预测 方法 存储 介质 装置
【主权项】:
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