[发明专利]一种蛋白质相互作用网络比对方法和系统在审
申请号: | 202211717423.6 | 申请日: | 2022-12-29 |
公开(公告)号: | CN116110492A | 公开(公告)日: | 2023-05-12 |
发明(设计)人: | 陈璟;王子祥;任利军 | 申请(专利权)人: | 江南大学 |
主分类号: | G16B5/00 | 分类号: | G16B5/00;G16B15/00;G16B40/00 |
代理公司: | 苏州市中南伟业知识产权代理事务所(普通合伙) 32257 | 代理人: | 杨慧林 |
地址: | 214000 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明涉及一种蛋白质相互作用网络比对方法和系统,方法包括:获取两个蛋白质相互作用网络的结构信息;提取每个网络中所有节点的分层结构特征,并基于分层结构特征计算节点间的结构得分;基于结构得分构造多层的加权图,使每个节点在加权图上进行随机游走生成上下文序列;将两个网络中每个节点对应的上下文序输入词向量模型,得到每个节点对应的低维向量,并计算每个节点对应的低维向量之间的距离作为节点间的拓扑相似性;将节点间序列相似性和节点间的拓扑相似性结合,来计算节点间的相似性得分,并基于相似性得分构建节点间的相似性矩阵;根据节点间的相似性矩阵生成两个网络的节点比对结果。本发明有效提高蛋白质相互作用网络比对效率。 | ||
搜索关键词: | 一种 蛋白质 相互作用 网络 方法 系统 | ||
【主权项】:
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