[发明专利]一种检测差异化RNA编辑位点的方法在审
| 申请号: | 202211574812.8 | 申请日: | 2022-12-08 |
| 公开(公告)号: | CN116312776A | 公开(公告)日: | 2023-06-23 |
| 发明(设计)人: | 张弛;邱建华;张坤明;梁红远;瞿爱东 | 申请(专利权)人: | 上海生物制品研究所有限责任公司 |
| 主分类号: | G16B20/50 | 分类号: | G16B20/50;G16B20/20 |
| 代理公司: | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人: | 徐迅;崔佳佳 |
| 地址: | 200052 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | 本发明公开了一种检测差异化RNA编辑位点的方法。所述方法包括以下步骤:对一组包含两种及以上处理方式,或肿瘤与正常组织对照样本集进行高通量测序,分别获得DNA与RNA测序数据;通过对比DNA与RNA测序数据进行DNA/RNA联合突变检测,获得RNA编辑位点;对RNA候选编辑位点在在各样本集中的突变深度进行测量并组成数据集,并使用统计学手段评估每一个候选位点相对不同样本集的差异化编辑程度,从而筛选出具有统计学意义的差异化RNA编辑位点。使用本方法能以高灵敏度检出高置信度的差异化RNA编辑位点。 | ||
| 搜索关键词: | 一种 检测 异化 rna 编辑 方法 | ||
【主权项】:
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