[发明专利]基于氨基酸序列的密码子优化在mRNA疫苗研发中的应用在审
申请号: | 202211265184.5 | 申请日: | 2022-10-17 |
公开(公告)号: | CN116072231A | 公开(公告)日: | 2023-05-05 |
发明(设计)人: | 钱朝晖;陆剑;昝富文;吴鑫凯;单科家 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院病原生物学研究所;北京大学 |
主分类号: | G16B50/40 | 分类号: | G16B50/40;G16B30/00;G16B25/10;C12N15/10 |
代理公司: | 北京万象新悦知识产权代理有限公司 11360 | 代理人: | 李稚婷 |
地址: | 100730*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明公开了基于氨基酸序列的密码子优化在mRNA疫苗研发中的应用。基于目标抗原蛋白的氨基酸序列,对其CDS在密码子适应指数(CAI)水平上进行优化得到HighestCAI序列,在最小折叠自由能(MFE)水平上进行优化得到LowestMFE序列,再以HighestCAI序列作为祖先序列进行MFE的定向优化,在某一个或某几个世代分别取MFE值最低的序列作为兼顾翻译效率和mRNA稳定性的优化序列,最终将这些序列通过细胞水平的蛋白表达验证,获得稳定高表达的CDS序列应用于mRNA疫苗的设计。本发明采用不同方式的密码子优化策略以提高mRNA疫苗转导机体后产生有效抗原量,为进一步优化疫苗生产提供了指导。 | ||
搜索关键词: | 基于 氨基酸 序列 密码子 优化 mrna 疫苗 研发 中的 应用 | ||
【主权项】:
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