[发明专利]基于多序列比对的酶序列生成方法、装置、介质和设备在审
| 申请号: | 202211156880.2 | 申请日: | 2022-09-21 | 
| 公开(公告)号: | CN115472224A | 公开(公告)日: | 2022-12-13 | 
| 发明(设计)人: | 余函;张洋铭;罗小舟 | 申请(专利权)人: | 中国科学院深圳先进技术研究院 | 
| 主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10;G16B40/00;G06N3/04;G06N3/08 | 
| 代理公司: | 深圳市铭粤知识产权代理有限公司 44304 | 代理人: | 孙伟峰;刘燚圣 | 
| 地址: | 518055 广东省深圳*** | 国省代码: | 广东;44 | 
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| 摘要: | 本发明公开了一种基于多序列比对的酶序列生成方法、装置、介质和设备。该酶序列生成方法包括:从序列数据库中筛选出与目标酶的完整氨基酸序列相似的若干条相似氨基酸序列;将完整氨基酸序列和若干条相似氨基酸序列进行多序列比对处理,获得若干条对齐氨基酸序列,其中各条对齐氨基酸序列的长度相同;将若干条对齐氨基酸序列作为训练样本对预先构建好的生成式对抗网络模型进行训练,获得氨基酸序列生成模型;利用氨基酸序列生成模型生成目标酶的多条扩展氨基酸序列。通过筛选相似的天然氨基酸序列并进行多序列比对处理,模型可以充分学习到并保留氨基酸序列中的关键位点信息,这样利用模型生成全新的氨基酸序列中具有酶活性的比例更高。 | ||
| 搜索关键词: | 基于 序列 生成 方法 装置 介质 设备 | ||
【主权项】:
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