[发明专利]一种基于多头注意力的蛋白质翻译后修饰预测方法在审

专利信息
申请号: 202210989623.0 申请日: 2022-08-18
公开(公告)号: CN115394355A 公开(公告)日: 2022-11-25
发明(设计)人: 闫科;高辉;康昭;何跃武;徐辉 申请(专利权)人: 电子科技大学
主分类号: G16B20/00 分类号: G16B20/00;G16B40/20;G06F40/237;G06F40/284;G06N3/08
代理公司: 山东诺诚智汇知识产权代理事务所(普通合伙) 37309 代理人: 金峰
地址: 611731 四川省成*** 国省代码: 四川;51
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摘要: 发明公开了一种基于多头注意力的蛋白质翻译后修饰预测方法,属于生物信息技术领域,包括如下步骤:预处理带有翻译后修饰标注信息的蛋白质序列,得到合法字符集、第二蛋白质序列数据集和基准数据集;基于合法字符集得到三种词汇表;对第二蛋白质序列数据集中的蛋白质序列样本进行多尺度划分,得到单个氨基酸尺度数据集、二肽尺度数据集和三肽尺度数据集;利用Skip‑gram模型结构对语料库进行训练,得到三种词向量模型;对基准数据集的蛋白质序列片段进行多头注意力模型的标签预测,得到蛋白质序列片段预测结果;本发明通过多尺度词向量全面利用原始蛋白质序列中的多肽组成信息,并降低了对于生物学特征工程的依赖。
搜索关键词: 一种 基于 多头 注意力 蛋白质 翻译 修饰 预测 方法
【主权项】:
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