[发明专利]一种基于图神经网络的单序列蛋白质接触图预测方法在审

专利信息
申请号: 202210950286.4 申请日: 2022-08-09
公开(公告)号: CN115312118A 公开(公告)日: 2022-11-08
发明(设计)人: 欧阳建权;唐欢容;高涌露 申请(专利权)人: 湘潭大学
主分类号: G16B15/20 分类号: G16B15/20;G16B30/00;G16B40/00;G06N3/04
代理公司: 北京卓恒知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11394 代理人: 徐楼
地址: 41020*** 国省代码: 湖南;43
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摘要: 发明属于蛋白质图谱预测领域,公开了一种基于图神经网络的单序列蛋白质接触图预测方法,包括以下步骤:收集蛋白质序列及对应的蛋白质三维结构数据,构建残基间接触矩阵;对每个蛋白质序列进行one‑hot编码处理,得到one‑hot一维特征;将每个蛋白质序列通过预训练模型得到一维蛋白质编码特征和二维注意力矩阵特征;构建图卷积编码模型和卷积解码模型;将one‑hot一维特征和预训练得到的一维蛋白质编码特征作为输入特征输入到图卷积编码模型得到蛋白质结构编码特征;将蛋白质结构编码特征和预训练得到的二维注意力矩阵输入到卷积编码模型中得到蛋白质序列中残基对接触预测矩阵。将本发明提供的方法生成的蛋白质接触图与真实接触图相似度高,预测精度好。
搜索关键词: 一种 基于 神经网络 序列 蛋白质 接触 预测 方法
【主权项】:
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