[发明专利]一种融合序列及网络嵌入的病毒宿主蛋白-蛋白相互作用预测方法在审
| 申请号： | 202210651688.4 | 申请日： | 2022-06-10 |
| 公开（公告）号： | CN115035954A | 公开（公告）日： | 2022-09-09 |
| 发明（设计）人： | 刘宏生;徐鑫;张力 | 申请（专利权）人： | 辽宁大学 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B40/00;G16B5/00;G06N3/04;G06N3/08 |
| 代理公司： | 沈阳杰克知识产权代理有限公司 21207 | 代理人： | 王洋 |
| 地址： | 110000 辽宁*** | 国省代码： | 辽宁;21 |
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| 摘要： | 一种融合序列及网络嵌入的病毒宿主蛋白‑蛋白相互作用预测方法，步骤1：对数据进行预处理；步骤2：使用Doc2vec方法提取病毒及宿主蛋白质序列特征，对蛋白质序列进行矢量化；步骤3：构建宿主蛋白‑蛋白相互作用网络及病毒蛋白质序列相似性网络；步骤4：使用Node2vec算法提取上述两个网络的特征，将网络矢量化后与序列特征进行数量积；步骤5：根据得到的融合上述两种特征的矩阵，构建长短期记忆网络进行训练，将训练好的模型用于预测。本发明考虑到了蛋白质相互作用的网络特征，利用Node2vec模型对蛋白质相互作用网络特征建模，将网络特征与序列特征融合起来，更好地提高了病毒宿主蛋白‑蛋白相互作用预测的正确率。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 融合 序列 网络 嵌入 病毒 宿主 蛋白 相互作用 预测 方法 | ||
【主权项】：
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