[发明专利]样本同源性判定模型及其建立方法和应用在审

专利信息
申请号: 202210543729.8 申请日: 2022-05-19
公开(公告)号: CN114944188A 公开(公告)日: 2022-08-26
发明(设计)人: 许腾;巫文才;陈文景;沈杨;秦子颖;李永军;王小锐 申请(专利权)人: 广州微远基因科技有限公司;广州微远医疗器械有限公司;广州微远医学检验实验室有限公司;深圳微远医疗科技有限公司;微远(深圳)医学研究中心有限公司
主分类号: G16B5/00 分类号: G16B5/00;G16B30/10;G16B40/20
代理公司: 广州新诺专利商标事务所有限公司 44100 代理人: 李海恬
地址: 510130 广东省广州市高新技术产业开发*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明涉及一种样本同源性判定模型及其建立方法和应用,属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤:样本收集:以同一来源的两样本为阳性样本对组成阳性样本集合,以不同来源的两样本为阴性样本对组成阴性样本集合;SNV数据收集:将测序数据比对至人类参考基因组,获得各样本单核苷酸变异位点SNV情况,任意挑选样本对,统计分型不一致位点数与共同检出位点数的比值为错配率;模型构建:以样本测序数据量、目标序列区域、SNV过滤条件和基因型差异为模型参数条件,以错配率为判定指标,根据样本共同检出位点数量的梯度范围对应匹配的错配率,构建分类模型。该模型能够用于样本测序深度较低的场景,完成样本的同源性判定,具有成本低且高效快速的优势。
搜索关键词: 样本 同源性 判定 模型 及其 建立 方法 应用
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