[发明专利]一种ADAR蛋白细胞内高效结合底物及应用在审
| 申请号： | 202210342659.X | 申请日： | 2020-03-09 |
| 公开（公告）号： | CN114958834A | 公开（公告）日： | 2022-08-30 |
| 发明（设计）人： | 张锐;杨文兵;宋玉龙 | 申请（专利权）人： | 中山大学 |
| 主分类号： | C12N15/11 | 分类号： | C12N15/11;C12N15/113;C12Q1/6809 |
| 代理公司： | 北京市万慧达律师事务所 11111 | 代理人： | 谢敏楠 |
| 地址： | 510275 广东省广*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种获取ADAR蛋白细胞内高效结合的底物序列的方法及底物序列和应用。所述方法包括如下步骤：S1.细胞准备及蛋白与RNA交联反应；S2.免疫共沉淀及双链RNA消化，连接，和逆转录；S3.cDNA环化、建库和高通量测序；S4.ADAR底物拼装；S5.高效结合底物的评估。本发明首次开发了一种获取ADAR蛋白细胞内高效结合的底物序列的方法irCLASH，本发明从实验及生物信息学的角度填补现有ADAR1结合底物研究存在的空缺，与现有其他研究蛋白与RNA相互作用的方法相比，可显著提高嵌合体读长的得率，可最大限度提高了ADAR蛋白作用底物的构建数量，同时缩短实验耗时、简化了实验操作。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 adar 蛋白 细胞内 高效 结合 应用 | ||
【主权项】：
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