[发明专利]一种使用序列k-mer频率优化特征精准识别土壤致病菌污染的方法在审

专利信息
申请号: 202210294418.2 申请日: 2022-03-24
公开(公告)号: CN114842908A 公开(公告)日: 2022-08-02
发明(设计)人: 江高飞;薛卫;韦中;张家璇;张耀中;徐阳春;沈其荣 申请(专利权)人: 南京农业大学
主分类号: G16B30/00 分类号: G16B30/00;G16B40/00;G06N3/04;G06N3/08
代理公司: 南京天华专利代理有限责任公司 32218 代理人: 许轲;徐冬涛
地址: 210095 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种使用序列k‑mer频率优化特征精准识别土壤致病菌污染的方法,其步骤为:步骤一、选取合适的k‑mer片段长度,进行频率特征提取;步骤二、对提取的数据进行归一化处理;步骤三、构建交叉融合神经网络;网络由输入层、残差网络、深度网络、交叉网络和特征合并层组成;步骤四、模型预测;第一次使用先训练神经网络参数,再将待预测细菌DNA序列通过步骤一方法提取频率特征,送入训练好的残差神经网络,输出预测结果。本发明准确率优于现有k‑mer特征预测算法;自动地将k‑mer特征组合在一起,高效学习低维特征交叉和高维非线性特征,生成更优的模型。模型不需要人工特征工程或遍历搜索,具有较低的计算成本。
搜索关键词: 一种 使用 序列 mer 频率 优化 特征 精准 识别 土壤 致病菌 污染 方法
【主权项】:
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