[发明专利]一种使用序列k-mer频率优化特征精准识别土壤致病菌污染的方法在审
申请号: | 202210294418.2 | 申请日: | 2022-03-24 |
公开(公告)号: | CN114842908A | 公开(公告)日: | 2022-08-02 |
发明(设计)人: | 江高飞;薛卫;韦中;张家璇;张耀中;徐阳春;沈其荣 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
主分类号: | G16B30/00 | 分类号: | G16B30/00;G16B40/00;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 许轲;徐冬涛 |
地址: | 210095 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明公开了一种使用序列k‑mer频率优化特征精准识别土壤致病菌污染的方法,其步骤为:步骤一、选取合适的k‑mer片段长度,进行频率特征提取;步骤二、对提取的数据进行归一化处理;步骤三、构建交叉融合神经网络;网络由输入层、残差网络、深度网络、交叉网络和特征合并层组成;步骤四、模型预测;第一次使用先训练神经网络参数,再将待预测细菌DNA序列通过步骤一方法提取频率特征,送入训练好的残差神经网络,输出预测结果。本发明准确率优于现有k‑mer特征预测算法;自动地将k‑mer特征组合在一起,高效学习低维特征交叉和高维非线性特征,生成更优的模型。模型不需要人工特征工程或遍历搜索,具有较低的计算成本。 | ||
搜索关键词: | 一种 使用 序列 mer 频率 优化 特征 精准 识别 土壤 致病菌 污染 方法 | ||
【主权项】:
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