[发明专利]快速筛选小鼠mmu-miR-25-3p与启动子结合靶点的方法有效

专利信息
申请号: 202210261235.0 申请日: 2022-03-16
公开(公告)号: CN114550821B 公开(公告)日: 2023-05-30
发明(设计)人: 蒋澜;王祖贞;吕坤;童九翠;杨建课;冯翔;邓汉诺;罗天乐;汪乐瑶;杜金锐 申请(专利权)人: 皖南医学院第一附属医院(皖南医学院弋矶山医院)
主分类号: G16B20/30 分类号: G16B20/30
代理公司: 南京业腾知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 32321 代理人: 马静静
地址: 241000*** 国省代码: 安徽;34
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摘要: 发明公开一种快速筛选小鼠mmu‑miR‑25‑3p与启动子结合靶点的方法,包括如下步骤:下载小鼠最新基因组序列和对应的注释文件,以及小鼠mmu‑miR‑25‑3p序列文件;从下载的小鼠最新基因组序列中提取小鼠最新基因组序列的染色体长度,并由此从小鼠最新基因组序列和对应的注释文件中提取启动子的序列;通过seedVicious软件筛选小鼠mmu‑miR‑25‑3p序列与S2提取的启动子序列,保留与miRNA种子序列完全匹配靶标的种类,获得mmu‑miR‑25‑3p与启动子靶标的预测结果。本发明利用现有数据和软件,在计算机上实现快速对小鼠mmu‑miR‑25‑3p与启动子结合靶点的筛选。
搜索关键词: 快速 筛选 小鼠 mmu mir 25 启动子 结合 方法
【主权项】:
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