[发明专利]基于微生物丰度的MIBC分型及预后预测模型构建方法有效

专利信息
申请号: 202210148697.1 申请日: 2022-02-18
公开(公告)号: CN114203256B 公开(公告)日: 2022-06-21
发明(设计)人: 金鸽;薛银鸽;林为丽;徐小红;赵婷婷 申请(专利权)人: 上海仁东医学检验所有限公司;苏州仁东生物工程有限公司
主分类号: G16B15/30 分类号: G16B15/30;G16B20/00;G16B30/00;G16B40/00
代理公司: 上海市汇业律师事务所 31325 代理人: 陆红杰
地址: 201318 上海市浦东新*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明公开了一种肌层浸润性膀胱癌(MIBC)分型方法,该方法依据MIBC患者的组织微生物丰度谱特征对MIBC进行分子分型。本发明还公开了基于上述分型方法的MIBC预后预测模型及其构建方法。本发明利用TCGA数据库中的肌层浸润性膀胱癌转录组RNA‑seq数据,分析得到MIBC患者的微生物数据,然后以微生物丰度谱为特征进行NMF聚类,建立MIBC微生物层面的分子分型,从而从肿瘤组织微生物层面深度解析了微生物与MIBC的相关性,建立了MIBC预后预测模型,该模型有助于精准预测MIBC患者的1‑5年生存率。
搜索关键词: 基于 微生物 mibc 预后 预测 模型 构建 方法
【主权项】:
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