[发明专利]基于多特征的CTCF介导染色质环预测方法有效
| 申请号： | 202210086044.5 | 申请日： | 2022-01-25 |
| 公开（公告）号： | CN114550817B | 公开（公告）日： | 2022-12-23 |
| 发明（设计）人： | 罗静;彭文钰;于小娟;林国亮;颜培祺 | 申请（专利权）人： | 云南大学 |
| 主分类号： | G16B20/30 | 分类号： | G16B20/30;G16B30/10;G16B40/00;G16B40/10;G06F40/284;G06F40/30 |
| 代理公司： | 成都行之智信知识产权代理有限公司 51256 | 代理人： | 温利平 |
| 地址： | 650091*** | 国省代码： | 云南;53 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于多特征的CTCF介导染色质环预测方法，对于待预测的细胞系收集蛋白质数据和样本DNA序列，在样本DNA序列中确定4个关键位点及对应的CTCF motif数据，根据所有样本DNA序列的CTCF motif数据训练Word2Vec模型和Doc2Vec模型，对于每个样本DNA序列分别提取其序列特征和蛋白质特征，然后拼接得到该样本DNA序列的特征向量，将样本DNA序列的特征向量作为输入、将CTCF介导染色质环是否存在的样本标签作为期望输出，对构建的CTCF介导染色质环预测模型进行训练，当需要对待预测的细胞系某个DNA序列中两个位点之前是否存在CTCF介导染色质环进行预测时，采用相同方法得到特征向量，输入训练好的CTCF介导染色质环预测模型得到预测结果。本发明可有效提高CTCF介导染色质环的预测准确率。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 特征 ctcf 染色质 预测 方法 | ||
【主权项】：
暂无信息
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