[发明专利]过滤酶切建库方式引入噪音的方法和装置有效
| 申请号： | 202111649916.6 | 申请日： | 2021-12-29 |
| 公开（公告）号： | CN114334006B | 公开（公告）日： | 2022-11-29 |
| 发明（设计）人： | 蒋才;戴鹏;程陶然;朱文鑫 | 申请（专利权）人： | 纳昂达（南京）生物科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G06K9/62;G06F16/16 |
| 代理公司： | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人： | 路秀丽 |
| 地址： | 210031 江苏省南京市江北新区华康路*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种过滤酶切建库方式引入噪音的方法和装置。该方法包括：获取酶切建库双端测序下机数据并比对至参考基因组序列，再从中提取含有Soft Clip标记的读段，并统计各读段中Soft Clip碱基数；将Soft Clip碱基数大于阈值T1的读段记为候选处理序列，并提取各候选处理序列的比对位置以及Soft Clip碱基序列；根据各候选处理序列的比对位置前后延伸D长度得到延伸区域，并寻找与Soft Clip碱基序列相似的序列，若相似度大于阈值T2，视为含有酶切噪音的读段存于去除文件中；过滤掉含有的读段，得到去除噪音的比对文件。有效过滤artifact序列，提高检测准确性。 | ||
| 搜索关键词： | 过滤 酶切建库 方式 引入 噪音 方法 装置 | ||
【主权项】：
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