[发明专利]一种分子组学与计算结构联用的肿瘤新生抗原检测筛选方法及系统在审
| 申请号： | 202111462256.0 | 申请日： | 2021-12-02 |
| 公开（公告）号： | CN114333999A | 公开（公告）日： | 2022-04-12 |
| 发明（设计）人： | 戴文韬;刘继翔;李园园;顾婷婷 | 申请（专利权）人： | 上海朴岱生物科技合伙企业（有限合伙） |
| 主分类号： | G16B25/10 | 分类号： | G16B25/10;G16B20/30;G16B20/50;G16B35/20;G16B5/00;G16C20/20;G16C20/70 |
| 代理公司： | 上海德禾翰通律师事务所 31319 | 代理人： | 夏思秋 |
| 地址： | 200442 上海市宝*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种分子组学与计算结构联用的肿瘤新生抗原检测筛选方法。本发明公开的肿瘤新生抗原检测方法，能够快速高效地检测出表达量高并且能够与HLA高亲和力且稳定结合的肿瘤新生抗原。本发明还公开了一种预测TCR‑pMHC蛋白质三维结构的方法，从蛋白质结构的层面评估TCR、肿瘤新生抗原和MHC三者的亲和力和稳定性，并将TCR与pMHC的亲和力及稳定性预测筛选、抗原肽表达翻译和疏水及突变模式等综合纳入到肿瘤新生抗原的检测分析流程中。本发明还提出了进一步使用质谱方法验证筛选出的新生抗原在癌症病人中是否真实存在，评估抗原肽在人体中的结构稳定性。本发明还提出了预测肿瘤微环境的免疫细胞类型及比例的方法及系统。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 分子 计算 结构 联用 肿瘤 新生 抗原 检测 筛选 方法 系统 | ||
【主权项】：
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