[发明专利]一种利用共识性预测结果识别癌症驱动基因的方法在审
| 申请号： | 202110910593.5 | 申请日： | 2021-08-09 |
| 公开（公告）号： | CN113611363A | 公开（公告）日： | 2021-11-05 |
| 发明（设计）人： | 韦嘉;叶翔赟;吴金波 | 申请（专利权）人： | 上海基绪康生物科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B20/50 | 分类号： | G16B20/50;G16B45/00;G16B40/00 |
| 代理公司： | 武汉智新达知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 42272 | 代理人： | 谢厚霓 |
| 地址： | 200000 上海市浦东新区*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种利用共识性预测结果识别癌症驱动基因的方法，包括以下步骤：S1、接受突变注释格式(MAF)文件作为输入；S2、处理所有预处理的输入突变数据，以分别获得每种策略的候选驱动基因列表；S3、基于每个差异驱动基因列表，使用秩集成方法RobustRankAggreg来获得共有驱动基因列表；S4、使用Top‑N‑Precision和Top‑N‑nDCG评估结果性能，对共有驱动基因进行了KEGG途径和基因本体分析；S5、利用RAA算法获得共识驱动基因列表；S6、应用SuperExactTest和Circos来组织可视化结果。该方法在驱动基因预测中具有一定的优越性，尽管不同的驱动基因识别策略之间存在高度差异，但是通过各个单独策略进行结果的交叉分析不仅可以识别最可靠的驱动基因，而且还有助于发现潜在的，特征不明确的新型驱动基因。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 利用 共识 预测 结果 识别 癌症 驱动 基因 方法 | ||
【主权项】：
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