[发明专利]一种基于二代测序数据的HLA分型方法有效
| 申请号： | 202110559161.4 | 申请日： | 2021-05-21 |
| 公开（公告）号： | CN113409890B | 公开（公告）日： | 2022-04-12 |
| 发明（设计）人： | 丛华剑;张倩;郭现超;洪轲;陈守林;王燕 | 申请（专利权）人： | 银丰基因科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10 |
| 代理公司： | 济南泉城专利商标事务所 37218 | 代理人： | 赵玉凤 |
| 地址： | 250100 山东省济南市高*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于二代测序数据的HLA分型方法，本方法首先构建HLA参考序列数据库，然后进行二代测序数据分析。二代测序数据分析包括原始HLA数据质控与过滤、HLA参考序列进行序列比对、统计比对结果、重构HLA参考序列、进行二次比对和统计比对结果。二代测序数据分析后利用聚类算法与HLA序列特征判断序列杂合位置；根据杂合位置进行局部重比对，分离出单倍型序列；根据单倍型序列遍历HLA数据库，匹配出最佳HLA型别。本发明的分型方法可准确获得HLA型别结果，整体准确率在99%以上，大大提高了HLA二代测序数据的分析效率。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 二代 序数 hla 方法 | ||
【主权项】：
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