[发明专利]基于小样本的多组学数据中基因型与表型关联分析方法

摘要

公开一种基于小样本的多组学数据中基因型与表型关联分析方法，具体包括下列步骤：利用蛋白质网络和基因表达值生成带权无向基因关联图，并利用SPICi聚类方法对该无向图进行聚类，生成基因簇；利用group Lasso方法对基因簇进行筛选；通过eQTL数据得到筛选后的基因簇所对应的SNP簇；将每个SNP簇、所对应的基因簇及表型构建为一个三层网络类块，对每个类块中SNP与基因关联关系采用稀疏偏最小二乘方法进行回归运算，对基因与表型关联关系采用逻辑回归进行运算；对各类块所得预测结果求平均，得到最终预测结果。本发明能够解决三层网络中小样本情况下特征值庞大不能有效回归的问题；提高预测准确率；使生物意义更加明确；考虑了组织特异性。