[发明专利]一种基于网络表征的抗新冠炎症药物发现方法有效

专利信息
申请号: 202011226196.8 申请日: 2020-11-05
公开(公告)号: CN112309505B 公开(公告)日: 2021-08-17
发明(设计)人: 彭绍亮;王小奇;李非;辛彬;杨亚宁;向伟铭;李介臣 申请(专利权)人: 湖南大学
主分类号: G16B50/30 分类号: G16B50/30;G06F40/30;G16B30/00;G16B25/00;G16H70/40
代理公司: 国防科技大学专利服务中心 43202 代理人: 王文惠
地址: 410012 湖*** 国省代码: 湖南;43
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摘要: 发明属于计算机科学领域,公开了一种基于网络表征的抗新冠炎症药物发现方法。首先通过融合DrugBank、UniProt、HPRD、SIDER、CTD、NDFRT和STRING等多个数据库构建多源、异构、大规模的生物医药网络;然后,通过随机游走的方式在网络中进行序列采样构成网络序列库,利用Transformer的深层双向编码器表征技术对进行表征,得到每个节点的表征向量;利用归纳矩阵分解技术进行靶标‑药物相互作用预测,发现潜在的抗COVID‑19炎症药物,推理出相关药物的作用机理。本发明通过集成多源异构的信息,多样化的数据为药物研发提供了一个多层关联知识,进而提高了预测精度;其次,通过Transformer模型融合了多头注意力机制,可以不同程度的捕获网络节点之间的关联性与网络节点的物理距离,进而改善表征的性能。
搜索关键词: 一种 基于 网络 表征 抗新冠 炎症 药物 发现 方法
【主权项】:
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