[发明专利]一种基于网络表征的抗新冠炎症药物发现方法有效
申请号: | 202011226196.8 | 申请日: | 2020-11-05 |
公开(公告)号: | CN112309505B | 公开(公告)日: | 2021-08-17 |
发明(设计)人: | 彭绍亮;王小奇;李非;辛彬;杨亚宁;向伟铭;李介臣 | 申请(专利权)人: | 湖南大学 |
主分类号: | G16B50/30 | 分类号: | G16B50/30;G06F40/30;G16B30/00;G16B25/00;G16H70/40 |
代理公司: | 国防科技大学专利服务中心 43202 | 代理人: | 王文惠 |
地址: | 410012 湖*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | 本发明属于计算机科学领域,公开了一种基于网络表征的抗新冠炎症药物发现方法。首先通过融合DrugBank、UniProt、HPRD、SIDER、CTD、NDFRT和STRING等多个数据库构建多源、异构、大规模的生物医药网络;然后,通过随机游走的方式在网络中进行序列采样构成网络序列库,利用Transformer的深层双向编码器表征技术对进行表征,得到每个节点的表征向量;利用归纳矩阵分解技术进行靶标‑药物相互作用预测,发现潜在的抗COVID‑19炎症药物,推理出相关药物的作用机理。本发明通过集成多源异构的信息,多样化的数据为药物研发提供了一个多层关联知识,进而提高了预测精度;其次,通过Transformer模型融合了多头注意力机制,可以不同程度的捕获网络节点之间的关联性与网络节点的物理距离,进而改善表征的性能。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 网络 表征 抗新冠 炎症 药物 发现 方法 | ||
【主权项】:
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