[发明专利]基于高通量测序的病原体分析方法、装置和计算机设备有效
申请号: | 202011137959.1 | 申请日: | 2020-10-22 |
公开(公告)号: | CN112259167B | 公开(公告)日: | 2022-09-23 |
发明(设计)人: | 于闯;张优劲;贺增泉;王今安;晋向前 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因科技服务有限公司 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10;G16B30/20;G16B50/00 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 苏云辉 |
地址: | 518000 广东省深圳市盐田区*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明提供了一种基于高通量测序的病原体分析方法、装置和计算机设备,其方法包括获取待分析样本的测序数据,将测序数据的每一条序列按照K‑mer进行切分,得到多个K‑mer;对多个K‑mer进行哈希计算,并根据哈希计算后的K‑mer在预先建立的基因组哈希表查找每一条序列的所有K‑mer所对应的基因组位置和权重;根据每一条序列的所有K‑mer对应的权重计算出每一条序列的总权重;根据每一条序列的所有K‑mer所对应的基因组位置和每一条序列的总权重进行分类分析,确定病原体的物种属性。该方法只需要确定待分析的样本的每一条序列的K‑mer所在的位置以及权重即可确定物种属性且准确率高。 | ||
搜索关键词: | 基于 通量 病原体 分析 方法 装置 计算机 设备 | ||
【主权项】:
暂无信息
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