[发明专利]面向多核处理器的基因变异检测方法及系统有效
| 申请号： | 202011090874.2 | 申请日： | 2020-10-13 |
| 公开（公告）号： | CN112397142B | 公开（公告）日： | 2023-02-03 |
| 发明（设计）人： | 刘卫国;张浩;宋红磊;殷泽坤 | 申请（专利权）人： | 山东大学 |
| 主分类号： | G16B20/20 | 分类号： | G16B20/20;G16B20/30;G16B30/10 |
| 代理公司： | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人： | 黄海丽 |
| 地址： | 250014 山*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 本发明公开了面向多核处理器的基因变异检测方法，包括：对输入数据进行预处理；从预处理后得到的测序序列read提取简要比对信息表达式CIGAR信息；输入数据，是指：将待查询序列与参考序列进行比对得到的文件；对读取的测序序列read的简要比对信息表达式CIGAR信息进行修改；对修改后的测序序列read的简要比对信息表达式CIGAR信息进行处理，处理过程中从内存池中进行候选变异数据的调取，得到候选变异集合；对候选变异集合中变异的基因进行局部重比对，以降低假阳性变异的检测；对局部重比对后的变异的基因进行格式化处理，将格式化处理后的变异基因输出到输出文件中，并且将内存池中数据进行重置以便进行反复的使用。 | ||
| 搜索关键词： | 面向 多核 处理器 基因 变异 检测 方法 系统 | ||
【主权项】：
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