[发明专利]一种基于单细胞测序数据分析细胞轨迹的方法及电子设备在审
申请号: | 202010772219.9 | 申请日: | 2020-08-04 |
公开(公告)号: | CN111951892A | 公开(公告)日: | 2020-11-17 |
发明(设计)人: | 王亚静;蔡文君;李明壮 | 申请(专利权)人: | 荣联科技集团股份有限公司 |
主分类号: | G16B30/00 | 分类号: | G16B30/00;G16B20/00 |
代理公司: | 北京风雅颂专利代理有限公司 11403 | 代理人: | 郑颖颖 |
地址: | 100080 北京市海淀*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明提供一种基于单细胞测序数据分析细胞轨迹的方法,对单细胞测序数据进行初始分析,得到各个细胞的细胞‑基因表达矩阵;统计各个细胞的表达基因数分布、UMI条数分布和线粒体含量分布;筛选高质量细胞;对高质量细胞进行保留高可变特征基因、降维分析以及细胞分群,得到细胞亚群;筛选细胞亚群上调的差异表达基因;保留具有细胞亚群上调的差异表达基因的高质量细胞,构建细胞轨迹,分析细胞轨迹,得到在不同状态之间差异表达的基因。能够对单细胞测序数据进行过滤,凸显关键基因在细胞轨迹中的作用,降低分析的噪音和干扰,降低了计算资源的消耗,使得对硬件的需求降低,易于推广应用。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 单细胞 序数 分析 细胞 轨迹 方法 电子设备 | ||
【主权项】:
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