[发明专利]基于重测序数据中多态性位点密度鉴定小麦育种的基因组选择利用区间的方法在审
| 申请号： | 202010742489.5 | 申请日： | 2020-07-29 |
| 公开（公告）号： | CN111798922A | 公开（公告）日： | 2020-10-20 |
| 发明（设计）人： | 郭伟龙;杨正钊;孙其信;王梓豪;倪中福;彭惠茹;王文熙;胡兆荣;姚颖垠;辛明明 | 申请（专利权）人： | 中国农业大学 |
| 主分类号： | G16B20/20 | 分类号： | G16B20/20;G16B20/30;G16B30/10;G06K9/62 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 任凤华 |
| 地址： | 100193 *** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了基于重测序数据中多态性位点密度鉴定小麦育种的基因组选择利用区间的方法。该方法包括提取待鉴定作物材料基因组DNA并进行全基因组重测序；质控重测序数据并将其比对到作物参考基因组上得到DNA序列比对文件；分别过滤鉴定待鉴定作物材料得到待鉴定作物材料与作物参考基因组相比的排除CNV变异区间的SNP变异位点；计算所述得到的待鉴定作物材料SNP变异位点之间的差异SNP变异位点的密度分布；根据密度分布拟合得到混合正态分布后根据分布边界确定阈值，得到待鉴定作物材料之间的SNP多态性热点区间和SNP低频变异区间。本发明可用于确定不同品种间的遗传差异，从基因组水平对种质资源的相似性进行评估。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 序数 多态性 密度 鉴定 小麦 育种 基因组 选择 利用 区间 方法 | ||
【主权项】：
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