[发明专利]一种基于全基因组SNP信息追溯水牛血统来源以及进行基因组选配的方法有效
| 申请号： | 202010198365.5 | 申请日： | 2020-03-19 |
| 公开（公告）号： | CN111370058B | 公开（公告）日： | 2022-12-06 |
| 发明（设计）人： | 刘庆友;罗西尔;阮珏;石德顺;周宇;崔奎青;李志鹏;李辉;冯彤;王晓波 | 申请（专利权）人： | 佛山科学技术学院 |
| 主分类号： | G16B20/30 | 分类号： | G16B20/30;G16B20/20;G16B5/20;G06K9/62;C12Q1/6888 |
| 代理公司： | 北京国坤专利代理事务所(普通合伙) 11491 | 代理人： | 王峰刚 |
| 地址： | 528000 *** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明提供一种基于全基因组SNP信息追溯水牛血统来源以及基因组选配的方法，包括以下步骤：从待血统测验的水牛个体中提取DNA并测序，通过从数据库中下载世界主要水牛品种的二代测序数据，得到基因组SNP的基因型信息；将基因组SNP位点进行质控筛选，选取SNP位点；将获得的SNP信息合并，将SNP数据转换为PLINK的ped格式，进行STUCTURE分析，预设不同K值，推测亚群类型；计算待测水牛之间的近交系数，为后续基因组选配提供基础。本发明能够对血统进行更准确地追溯；新的追溯方法按比例显示各种组成成分，可依此对水牛选配，提升后代生产性能；通过计算个体之间亲缘关系，降低近亲配种概率。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 基因组 snp 信息 追溯 水牛 血统 来源 以及 进行 选配 方法 | ||
【主权项】：
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