[发明专利]微生物群落物种多样性数据的存储检索方法有效

专利信息
申请号: 202010043999.3 申请日: 2020-01-15
公开(公告)号: CN111243679B 公开(公告)日: 2023-03-31
发明(设计)人: 白明泽;黄家顺;覃春园;邓川 申请(专利权)人: 重庆邮电大学
主分类号: G16B50/30 分类号: G16B50/30
代理公司: 重庆辉腾律师事务所 50215 代理人: 王海军
地址: 400065 重*** 国省代码: 重庆;50
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摘要: 发明涉及生物信息学领域,具体涉及一种微生物群落物种多样性数据的存储检索方法,包括:确定需要存储到ElasticSearch中的数据;根据ElasticSearch的要求建立存储数据的index;收集并存储数据到ElasticSearch中;构建检索功能获取分类单元的谱系信息;根据分类单元的谱系信息计算肽段对应的分类单元的最小公共祖先,用所有肽段对应的最小公共祖先表示整个微生物群落的物种多样性分布。本发明在ElasticSearch中配置满足相应水解酶水解规则的分词器,不需要编写处理酶切和漏切代码;若蛋白质序列库更新不需要重新计算最小公共祖先进行存储。
搜索关键词: 微生物 群落 物种 多样性 数据 存储 检索 方法
【主权项】:
暂无信息
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