[发明专利]基于stacking集成的RNA中N6

摘要

本发明公开了基于stacking集成的RNA中N6‑甲基腺苷修饰位点预测方法，涉及系统生物学领域。通过6种特征提取方法提取酿酒酵母、智人和拟南芥3个物种的RNA序列特征，通过特征融合得到原始数据集的初始特征空间；利用弹性网络对其进行降维，剔除冗余、噪声特征，保留对模型分类相关的重要特征，得到最佳特征集合；把最优特征子集以及所对应的类别标签输入到stacking集成中进行模型训练，并结合评价指标评估模型的预测性能，得到预测模型；将测试集中待预测的RNA序列，输入至预测模型中，预测m6A位点并输出。此模型在测试集上的预测准确率分别达到92.30％和87.06％，在跨物种预测方面具有很好的发展潜力，可成为鉴定m6A位点的有用工具。