[发明专利]一种融合基因检测方法、系统和介质有效
申请号: | 201911243763.8 | 申请日: | 2019-12-06 |
公开(公告)号: | CN111081318B | 公开(公告)日: | 2023-06-06 |
发明(设计)人: | 曾华萍;传军;吴桂枝;王益民 | 申请(专利权)人: | 人和未来生物科技(长沙)有限公司 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G16B30/10;G16B20/00 |
代理公司: | 湖南兆弘专利事务所(普通合伙) 43008 | 代理人: | 邹大坚 |
地址: | 410000 湖南省长沙市长沙高*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | 本发明公开了一种融合基因检测方法、系统和介质,本发明实施步骤包括:确定输入文件,对输入文件的各条测序读段read进行过滤后,获取断点信息和断点关系并进行频数统计;针对找到的每一个断点,确定该断点的融合kmer序列及参考kmer序列,判断覆盖该断点的测序读段read是融合读段还是参考读段并进行统计计数;判断各个成对断点融合类型和所在基因,输出各个成对断点的融合基因检测结果。本发明能够极大地减少数据处理量和提高数据融合基因检测的效率;本发明充分考虑了重叠的融合方式,融合方式检测更加明确,能够可实现精确分析断裂读段的比对情况对融合基因进行精确检测,具有速度快、检测频率精准、灵敏度高的优点。 | ||
搜索关键词: | 一种 融合 基因 检测 方法 系统 介质 | ||
【主权项】:
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