[发明专利]一种基于邻域子图连通性的蛋白质预测方法在审

专利信息
申请号: 201911014545.7 申请日: 2019-10-24
公开(公告)号: CN110782944A 公开(公告)日: 2020-02-11
发明(设计)人: 王雷;邹赛;朱贤友;陈治平 申请(专利权)人: 长沙学院;重庆电子工程职业学院
主分类号: G16B15/20 分类号: G16B15/20;G16B40/00
代理公司: 50223 重庆蕴博君晟知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人: 郑勇
地址: 410022 湖*** 国省代码: 湖南;43
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摘要: 一种基于邻域子图连通性的蛋白质预测方法。本发明将基因表达信息与PPI网络相结合,提出了一种新的基于邻域子图连通性的无参数蛋白质识别方法。首先采用数学语言定义PPI网络的邻域子图,其次基于基因表达数据构建加权邻域子图,最后定义邻接子图连通性来衡量蛋白质的重要性,实验表明本发明具有很好的性能。
搜索关键词: 邻域 连通性 基因表达数据 基因表达信息 蛋白质识别 蛋白质预测 数学语言 邻接 构建 加权 蛋白质 网络 衡量
【主权项】:
1.一种基于邻域子图连通性的蛋白质预测方法,其特征在于,包括以下步骤,/nS1:采用V表示PPI网络的节点,E表示PPI网络的边,建立无向图G=(V,E),无向图的节点由蛋白质组成,无向图的边由相互作用的蛋白质的连线构成;/nS2:令(u,v)表示路径上每条边的权值之和,dis
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