[发明专利]一种基因序列比对方法及装置有效
申请号: | 201910807357.3 | 申请日: | 2019-08-29 |
公开(公告)号: | CN110517728B | 公开(公告)日: | 2022-04-29 |
发明(设计)人: | 葛沅;史宏志;赵健 | 申请(专利权)人: | 苏州浪潮智能科技有限公司 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 张建 |
地址: | 215100 江苏省苏州市吴*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明公开了一种基因序列比对方法及装置,可以根据待检测的基因序列生成第一哈希值序列;将第一哈希值序列分别与标准哈希值序列中的各哈希值子序列进行比对,确定第一哈希值序列分别相对于各哈希值子序列的比对结果,比对结果为相同或不相同,其中,标准哈希值序列根据标准基因序列生成;根据比对结果确定第一数量和第二数量,根据第一数量和第二数量确定待检测的基因序列与标准基因序列的匹配程度,其中,各比对结果中为不相同的比对结果的数量为第一数量,各比对结果中为相同的比对结果对应的各哈希值子序列中相邻的哈希值子序列的数量为第二数量。本发明通过各比对结果的数量,可以获得准确的待检测的基因序列与标准基因序列的匹配程度。 | ||
搜索关键词: | 一种 基因 序列 方法 装置 | ||
【主权项】:
1.一种基因序列比对方法,其特征在于,包括:/n根据待检测的基因序列生成第一哈希值序列;/n将所述第一哈希值序列分别与标准哈希值序列中的各哈希值子序列进行比对,确定所述第一哈希值序列分别相对于各所述哈希值子序列的比对结果,所述比对结果为相同或不相同,其中,所述标准哈希值序列根据标准基因序列生成;/n根据所述比对结果确定第一数量和第二数量,根据所述第一数量和所述第二数量确定所述待检测的基因序列与所述标准基因序列的匹配程度,其中,各所述比对结果中为不相同的比对结果的数量为所述第一数量,各所述比对结果中为相同的比对结果对应的各哈希值子序列中相邻的哈希值子序列的数量为所述第二数量。/n
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