[发明专利]一键化完成多场景菌种鉴定的工作方法及系统有效
申请号: | 201910797146.6 | 申请日: | 2019-08-27 |
公开(公告)号: | CN110504007B | 公开(公告)日: | 2023-03-14 |
发明(设计)人: | 丁赟;赵建华;罗春 | 申请(专利权)人: | 上海美吉生物医药科技有限公司 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10;G16B50/30;G06Q10/10;G06Q30/0601;G06Q30/018 |
代理公司: | 北京哌智科创知识产权代理事务所(普通合伙) 11745 | 代理人: | 何浩 |
地址: | 200120 上海市浦东新区中国(上海)*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明公开了一种一键化完成多场景菌种鉴定的工作方法及系统,该方法包括:从常规测序系统获取生产订单下各样品信息及sanger测序结果;在服务器上,通过预设软件对各样品的sanger测序结果进行色谱信号转化、碱基修剪、序列组装,得到各样品的contig序列;利用预设的序列比对工具,将所得的各样品的contig序列批量与本地预设的能够获取序列对应物种信息的数据库进行比对;基于所得的比对结果,获取各样品物种信息;基于所获取的各样品物种信息,根据高通量生产系统中各客户送样订单下的样品制备任务单,汇总菌种鉴定结果。本发明的技术方案可一键化完成多场景菌种鉴定工作,并提高了菌种鉴定的工作效率及其结果的准确度。 | ||
搜索关键词: | 一键化 完成 场景 菌种 鉴定 工作 方法 系统 | ||
【主权项】:
1.一种一键化完成多场景菌种鉴定的工作方法,其特征在于,包括:/n从常规测序系统获取生产订单下各样品信息及sanger测序结果;/n在服务器上,通过预设软件对各样品的sanger测序结果进行色谱信号转化、碱基修剪、序列组装,得到各样品的contig序列;/n利用预设的序列比对工具,将所得的各样品的contig序列批量与本地预设的能够获取序列对应物种信息的数据库进行比对;/n基于所得的比对结果,获取各样品物种信息;/n基于所获取的各样品物种信息,根据高通量生产系统中各客户送样订单下的样品制备任务单,汇总菌种鉴定结果。/n
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