[发明专利]序列比对方法及系统有效
| 申请号： | 201910796168.0 | 申请日： | 2019-08-23 |
| 公开（公告）号： | CN110517727B | 公开（公告）日： | 2022-03-08 |
| 发明（设计）人： | 赵健;史宏志;崔星辰 | 申请（专利权）人： | 苏州浪潮智能科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10 |
| 代理公司： | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人： | 李慧引 |
| 地址： | 215100 江苏省苏州市吴*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种序列比对方法及系统，查找待比对序列中所有种子的候选比对位置，并在对所有种子的候选比对位置进行归一化处理后，通过位图的方式获取各种类的最长种子，然后过滤掉所有被最长种子覆盖的种子，以此减少后续需要比对的候选对比位置数量，从而极大的减少了后续比对工作的工作量，提高序列比对速度的同时保证了对比精度。 | ||
| 搜索关键词： | 序列 方法 系统 | ||
【主权项】：
1.一种序列比对方法，其特征在于，包括：/n查找待比对序列中的所有种子，并根据所述种子查找候选比对位置表，确定所述所有种子在参考序列上的候选对比位置；/n根据所述所有种子在所述待比对序列中的位置，将所述所有种子在参考序列上的候选对比位置进行归一化处理，得到所有种子的归一化的候选对比位置；/n根据所述归一化的候选对比位置，通过位图的方式选取所有种类的最长种子；/n过滤掉所有被所述所有种类的最长种子覆盖的种子，得到过滤后的种子；/n将所述过滤后的种子与所述过滤后的种子中各个种子相对应的候选对比位置进行比对，得到序列比对结果。/n
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