[发明专利]利用单细胞转录和基因敲除数据推断基因调控网络的方法有效
| 申请号： | 201910636618.X | 申请日： | 2019-07-15 |
| 公开（公告）号： | CN110517724B | 公开（公告）日： | 2020-05-22 |
| 发明（设计）人： | 王会青;董春林;廉元元 | 申请（专利权）人： | 太原理工大学 |
| 主分类号： | G16B5/20 | 分类号： | G16B5/20;G16B40/00 |
| 代理公司： | 成都东恒知盛知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 51304 | 代理人： | 何健雄 |
| 地址： | 030000 *** | 国省代码： | 山西;14 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明公开了一种利用单细胞转录和基因敲除数据推断基因调控网络的方法，通过分析基因敲除前后的稳态表达数据对基因进行分类，作为先验知识以降低时空复杂度并提升推断准确度；利用单细胞转录数据计算基因间分布距离，结合基因分类的结果为每个基因建立多时间点的多维回归模型，采用数学方法计算模型中的关系因子；对基因敲除数据进行相应的算法分析以去除部分假阳性判断，弥补分析动态数据的缺陷；本发明有效解决了分析时间序列单细胞数据中高计算复杂度的问题，提升了推断基因调控网络的准确度。 | ||
| 搜索关键词： | 利用 单细胞 转录 基因 数据 推断 调控 网络 方法 | ||
【主权项】：
1.一种利用单细胞转录和基因敲除数据推断基因调控网络的方法，其特征在于，包括：/n步骤一、利用基因敲除技术分别收集多个细胞中的稳态基因转录表达数据，刺激各个细胞后，在多个时间点收集单个细胞的转录表达数据；/n步骤二、分析基因敲除前后的稳态表达数据对基因进行分类；/n步骤三、利用单细胞转录数据计算基因间分布距离，结合基因分类的先验知识为每个基因建立多时间点的多维回归模型，采用数学方法计算模型中的关系因子；/n步骤四、对基因敲除数据进行相应的算法分析去除部分假阳性判断；/n步骤五、根据所推断的基因间关系确定基因调控网络。/n
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于太原理工大学，未经太原理工大学许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201910636618.X/，转载请声明来源钻瓜专利网。
