[发明专利]一种从微量松根或菌根组织中提取高质量总RNA的方法在审
申请号: | 201910614314.3 | 申请日: | 2019-07-09 |
公开(公告)号: | CN110283817A | 公开(公告)日: | 2019-09-27 |
发明(设计)人: | 唐年武;于富强 | 申请(专利权)人: | 中国科学院昆明植物研究所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 瞿晓晶 |
地址: | 650201 *** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | 本发明提供了一种从微量松根或菌根组织中提取高质量总RNA的方法,属于RNA提取技术领域。本发明通过改进现有的组织破碎方法,不仅使组织在破碎过程中得到了最大程度地保留,而且还有效避免了组织中RNA的降解;通过CTAB对组织进行高效裂解以及LiCl对RNA进行特异沉淀,实现从微量组织中高效提取高质量总RNA的目的。在本发明实施例中,针对鲜重为0.01g左右的火炬松和马尾松根或菌根组织,均能获得100~300μg/g的总RNA得率,提取得到的总RNA纯度高、完整性好,可满足绝大多数下游研究如转录组建库和测序、RT‑PCR等的要求;样品技术重复间数据一致性好,表明本发明方案稳定、可靠。 | ||
搜索关键词: | 总RNA 菌根 松根 数据一致性 最大程度地 转录 高效提取 马尾松根 微量组织 组织破碎 测序 得率 降解 裂解 沉淀 破碎 火炬 保留 重复 组建 改进 研究 | ||
【主权项】:
1.一种从微量松根或菌根组织中提取总RNA的方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)将微量松根或菌根组织置于破碎、裂解专用管中,投入液氮中迅速冷冻,得到经过冷冻的微量组织;所述微量松根或菌根组织的重量为0.009~0.013g;(2)将经过冷冻的所述微量组织置于组织研磨仪上,60Hz研磨30~40s后,重新置于液氮中;(3)向所述破碎、裂解专用管中加入1mL改良CTAB裂解液,涡旋振荡10~20s后65℃温育10~15min,得到温育后的裂解匀浆;每升所述改良CTAB裂解液中包括以下体积百分含量的试剂:2%CTAB,2%PVP,2%β‑巯基乙醇和100mM Tris‑HCl,25mM EDTA和2M NaCl;(4)收集温育后的裂解匀浆与等体积的氯仿/异戊醇混合,涡旋5~10s后,10000g、4℃离心10min;所述氯仿/异戊醇中氯仿和异戊醇的体积比为24:1;(5)收集离心后的上清液与等体积的氯仿/异戊醇混合,涡旋5~10s后,12000g、4℃再次离心10min;所述氯仿/异戊醇中氯仿和异戊醇的体积比为24:1;(6)收集再次离心后的上清液与1/2体积的LiCl溶液混合,上下颠倒混匀后于4℃冰箱中沉淀12~16h;所述LiCl溶液的浓度为8M;(7)12000g、4℃离心10min,弃上清得沉淀的总RNA;(8)将所述沉淀的总RNA与体积浓度为70%的乙醇溶液混合洗涤后,10000g、4℃离心5min,弃上清得清洗总RNA;(9)将所述清洗总RNA再与体积浓度为70%的乙醇溶液混合洗涤后,10000g、4℃离心5min,弃上清并干燥,得纯化的总RNA;(10)向所述纯化的总RNA中加入30μL无DNA酶及RNA酶超纯水,得纯化的总RNA溶液。
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