[发明专利]一种准确识别分子相互作用及其极性和方向性方法有效
| 申请号： | 201910571327.7 | 申请日： | 2019-06-28 |
| 公开（公告）号： | CN110349620B | 公开（公告）日： | 2020-06-19 |
| 发明（设计）人： | 汪佳宏;章建平;黄仲曦;潘星华 | 申请（专利权）人： | 南方医科大学;广州序科码生物技术有限责任公司 |
| 主分类号： | G16B15/00 | 分类号： | G16B15/00;G16B20/00;G06K9/62 |
| 代理公司： | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人： | 颜希文;宋静娜 |
| 地址： | 510000 广东省广*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种从PubMed文献准确识别分子相互作用及其极性和方向性方法：利用PubMed文献挖掘的形式在医学文献数据库识别含有至少两个基因获得候选证据句子，收集训练数据，收集互作词并对其分类，简化训练语句提取描述基因调控的常见表达模式；将常见表达模式制定Semgrex表达式，依存树上抓取两两基因和互作词的三元关系，确定分子相互作用的方向，并根据上下文语义校正和明确分子相互作用及其极性，在训练集上反复检验和优化识别方法，最终将建立的基因调控识别方法应用于医学文献数据库的候选证据句子的识别，获得准确的分子相互作用及其极性和方向。本发明最大的优点是通过表达模式和互作词的限定提高识别的准确率。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 准确 识别 分子 相互作用 及其 极性 方向性 方法 | ||
【主权项】：
1.一种从PubMed文献准确识别分子相互作用及其极性和方向性方法，其特征在于，包括以下步骤：利用PubMed文献挖掘的形式在医学文献数据库识别含有至少两个基因获得候选证据句子，收集训练数据，收集互作词并对其分类，简化训练语句提取描述基因调控的常见表达模式；将常见表达模式制定Semgrex表达式，从Enhanced++Dependencies解析的依存树上抓取两两基因和互作词的三元关系，确定分子相互作用的方向，并根据上下文语义校正和明确分子相互作用及其极性，在训练集上反复检验和优化识别方法，最终将建立的基因调控识别方法应用于医学文献数据库的候选证据句子的识别，获得准确的分子相互作用及其极性和方向。
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