[发明专利]确定环境因素与菌群结构和功能相关性的方法及设备有效

专利信息
申请号: 201910334811.8 申请日: 2019-04-24
公开(公告)号: CN110111846B 公开(公告)日: 2023-03-14
发明(设计)人: 宁康;陈超云;何睿乔;成章昱;韩毛振;查毓国;杨朋硕;姚奇;周豪;钟朝芳 申请(专利权)人: 华中科技大学鄂州工业技术研究院;华中科技大学
主分类号: G16B30/10 分类号: G16B30/10;G16B40/00;C12Q1/6869
代理公司: 武汉智嘉联合知识产权代理事务所(普通合伙) 42231 代理人: 黄君军
地址: 436044 湖北*** 国省代码: 湖北;42
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摘要: 发明实施例提供了一种确定环境因素与菌群结构和功能相关性的方法及设备。其中,所述方法包括:采用第二代高通量测序,获取菌群样本中所有菌种的标记基因序列,对所述标记基因序列进行分析,得到所述菌种的可操作分类单元,并采用R语言对所述可操作分类单元进行可视化;根据所述菌种的可操作分类单元,对所述菌群样本进行差异性分析,得到所述菌群样本的菌群结构,结合半封闭环境特征参数,确定所述菌群结构和菌群功能,与环境因素的相关性。本发明实施例提供的确定环境因素与菌群结构和功能相关性的方法及设备,可以较为精确的确定环境因素与菌群结构和功能的相关性。
搜索关键词: 确定 环境 因素 结构 功能 相关性 方法 设备
【主权项】:
1.一种确定环境因素与菌群结构和功能相关性的方法,其特征在于,包括:采用第二代高通量测序,获取菌群样本中所有菌种的标记基因序列,对所述标记基因序列进行分析,得到所述菌种的可操作分类单元,并采用R语言对所述可操作分类单元进行可视化;根据所述菌种的可操作分类单元,对所述菌群样本进行差异性分析,得到所述菌群样本的菌群结构,结合半封闭环境特征参数,确定所述菌群结构和菌群功能,与环境因素的相关性。
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