[发明专利]基于特征挖掘的基因翻转变异检测方法在审
申请号: | 201910151021.6 | 申请日: | 2019-02-28 |
公开(公告)号: | CN109903815A | 公开(公告)日: | 2019-06-18 |
发明(设计)人: | 高敬阳;吴钟佳 | 申请(专利权)人: | 北京化工大学 |
主分类号: | G16B40/20 | 分类号: | G16B40/20;G16B20/20 |
代理公司: | 北京细软智谷知识产权代理有限责任公司 11471 | 代理人: | 涂凤琴 |
地址: | 100020 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明涉及一种基于特征挖掘的基因翻转变异检测方法,包括:获取基因翻转变异候选样本集;对所述基因翻转变异候选样本集进行特征提取,得到翻转变异特征集;对所述翻转变异特征集进行特征选择,得到翻转变异有效特征集;对所述翻转变异特征集进行有效性检验;利用从模拟样本中提取的翻转变异特征集训练SVM分类器,建立SVM分类器模型;泛化真实数据,得到真实翻转变异数据集。相比于常规的检测方法,本发明通过充分挖掘翻转变异特征,并结合机器学习模型的SVM分类器可有效地提升检测翻转的召回率与精确度,提升了翻转变异检测的有效性。 | ||
搜索关键词: | 翻转 特征集 变异检测 基因 候选样本 特征挖掘 机器学习模型 有效特征集 有效性检验 变异数据 变异特征 模拟样本 特征提取 特征选择 真实数据 常规的 有效地 检测 挖掘 | ||
【主权项】:
1.一种基于特征挖掘的基因翻转变异检测方法,其特征在于,包括:获取基因翻转变异候选样本集;对所述基因翻转变异样本集进行特征提取,得到翻转变异特征集;对所述翻转变异特征集进行特征选择;对提取的翻转变异特征进行有效性检验;建立翻转变异SVM分类器模型;泛化真实数据,得到真实翻转变异数据集。
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