[发明专利]一种用于评价化合物对基因通路活化作用的方法及装置有效
| 申请号： | 201910142574.5 | 申请日： | 2019-02-26 |
| 公开（公告）号： | CN109801676B | 公开（公告）日： | 2021-01-01 |
| 发明（设计）人： | 戴蝉;李瑛颖;管峥 | 申请（专利权）人： | 北京深度制耀科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00;G16B40/00 |
| 代理公司： | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人： | 王宝筠 |
| 地址： | 100176 北京市大兴区北京经济技*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本申请公开了一种用于评价化合物对基因通路活化作用的方法，包括：获取对照组的转录组数据和化合物研究组的转录组数据；根据对照组的转录组数据和化合物研究组的转录组数据，确定转录差异表达倍数数据；对相关基因做聚类处理，将共表达的基因聚类到同一组，获得多个基因共表达单元；获取基因通路，根据基因在基因通路中所起的促进作用、抑制作用、磷酸化作用和去磷酸化作用，相应地为基因通路中的各个基因分配其对应的权重系数，进而确定基因通路拓扑系数矩阵；根据转录差异表达倍数、基因共表达单元以及基因通路拓扑系数矩阵，确定用于评价化合物对于基因通路的活化作用的打分结果。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 用于 评价 化合物 基因 通路 活化 作用 方法 装置 | ||
【主权项】：
1.一种用于评价化合物对基因通路活化作用的方法，其特征在于，所述方法包括：获取对照组的转录组数据和化合物研究组的转录组数据；根据所述对照组的转录组数据和所述化合物研究组的转录组数据，获得转录差异表达倍数数据；对相关基因做聚类处理，将共表达的基因聚类到同一组，获得多个基因共表达单元；获取基因通路，根据基因在所述基因通路中所起的作用，为所述基因通路中的各个基因分配权重系数，获得基因通路拓扑系数矩阵；所述基因在基因通路中所起的作用包括：促进作用、抑制作用、磷酸化作用和去磷酸化作用；根据所述转录差异表达倍数数据、所述基因共表达单元以及所述基因通路拓扑系数矩阵，确定化合物在每条基因通路上的打分结果；所述打分结果用于评价该化合物对于所述基因通路的活化作用。
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