[发明专利]一种利用支持向量机构建肺癌计算机辅助检测模型的方法在审

专利信息
申请号: 201810058221.2 申请日: 2018-01-22
公开(公告)号: CN108346466A 公开(公告)日: 2018-07-31
发明(设计)人: 刘小军;林鸿煌;尹潼;陶涛;张玮 申请(专利权)人: 杭州米天基因科技有限公司
主分类号: G16H50/20 分类号: G16H50/20;G06F19/20
代理公司: 北京正理专利代理有限公司 11257 代理人: 张雪梅
地址: 310052 浙江省杭州市*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 发明公开一种利用支持向量机构建肺癌计算机辅助检测模型的方法,包括:获取受试者支气管上皮细胞,提取其RNA;根据RNA构建双链cDNA文库并进行测序;将测序结果与参考基因组进行比对,选择受试者的差异显著基因和差异显著变异;将差异显著基因和差异显著变异组合成的向量及表征受试者是否患肺癌的参数作为样本数据;设置采用径向基核函数的支持向量机模型中径向基核函数的协方差和惩罚因子的初始值和调整间隔;将样本数据随机划分为训练集和预测集,对训练集和预测集基于采用径向基核函数的支持向量机模型进行多次训练,根据预测集的结果是否正确分别调整协方差和惩罚因子,将调整后的采用径向基核函数的支持向量机模型作为肺癌计算机辅助检测模型。
搜索关键词: 径向基核函数 计算机辅助检测 支持向量机模型 肺癌 预测集 支持向量机构 惩罚因子 样本数据 协方差 训练集 测序 支气管上皮细胞 双链cDNA 基因 基因组 比对 构建 向量 文库 参考
【主权项】:
1.一种利用支持向量机构建肺癌计算机辅助检测模型的方法,其特征在于,包括:获取受试者支气管上皮细胞,提取受试者上皮细胞RNA;根据受试者上皮细胞RNA构建双链cDNA文库并进行测序;将测序结果与参考基因组进行比对,根据比对结果选择受试者的差异显著基因和差异显著变异;将受试者的差异显著基因和差异显著变异组合成的向量及表征受试者是否患肺癌的(0,1)值作为样本数据;分别设置采用径向基核函数的支持向量机模型中径向基核函数的协方差和惩罚因子的初始值和调整间隔;将样本数据随机划分为训练集和预测集,对训练集和预测集基于所述采用径向基核函数的支持向量机模型进行多次训练,根据预测集的结果是否正确分别调整协方差和惩罚因子,将协方差和惩罚因子调整后的所述采用径向基核函数的支持向量机模型作为肺癌计算机辅助检测模型。
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