[发明专利]一种多肽谱匹配数据的在线分析方法

摘要

本发明公开了一种多肽谱匹配数据的在线分析方法，适于从高通量串联质谱平台及数据库匹配引擎输出的多肽谱匹配中鉴定正确的匹配。主要步骤包括数据预处理、使用在线学习算法求解优化模型、根据训练得出的分类函数鉴定正确的多肽谱匹配。该技术通过积极集存贮并动态更新对分类函数起作用的样本，实现了大规模多肽谱匹配数据的高效鉴定，克服了现有方法在大规模数据集上存储量大、计算缓慢的缺陷。

主权项

1.一种多肽谱匹配数据的在线分析方法，其特征在于所述方法包括以下步骤：步骤1、数据预处理；步骤2、选取核函数k(xi,xj)并确定模型参数C1,C2和γ的值；步骤3、采用在线学习算法求解优化模型其中，为训练样本，x_i∈R^d为数据库搜索引擎输出的多肽谱匹配,y_i∈{‑1,+1}，诱骗PSM标签为“‑1”，目标PSM标签为“+1”，Ω_‑＝{i|y_i＝‑1},Ω₊＝{i|y_i＝+1}，w∈R^N是模型待求解的决策变量，C₁＞0,C₂＞0,λ＞0为模型参数，C₁表示负类样本(诱骗PSM)经验损失的权重，C₂表示正类样本(目标PSM)经验损失的权重，h(t)＝max(0,1‑t)为负类样本损失函数,R_γ(t)＝min(1‑γ,max(0,1‑t))为正类样本的损失函数，γ＜1为常数，f(x)＝<w,φ(x)>，φ(·)为特征映射；步骤4、依据训练得出的分类函数鉴定正确的多肽谱匹配。