[发明专利]用于自动注释和筛选生物序列的系统和方法在审
| 申请号： | 201780048980.4 | 申请日： | 2017-06-09 |
| 公开（公告）号： | CN109564769A | 公开（公告）日： | 2019-04-02 |
| 发明（设计）人： | 詹姆斯·迪甘斯 | 申请（专利权）人： | 特韦斯特生物科学公司 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00;G16B50/00;C12N15/10 |
| 代理公司： | 北京安信方达知识产权代理有限公司 11262 | 代理人： | 贺淑东 |
| 地址： | 美国加利*** | 国省代码： | 美国;US |
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| 摘要： | 本公开内容描述了用于基于团体知识和参与的有效生物安全的软件工具。本文描述的注释工具为合成生物学团体跟踪关于个体蛋白质与负面后果之间的联系的新兴科学提供了帮助。本文描述的筛选工具使得团体能够拓宽对生物安全性的兴趣和有效实践，从而使从业者和生物序列或构建体提供者有能力评估订单请求的安全性，而不用等到合成或甚至表达。此外，本文描述的筛选工具能够筛选同一订单或多个订单中的多核苷酸中与来自参考数据库的有害生物序列相关的序列。 | ||
| 搜索关键词： | 生物序列 筛选 团体 参考数据库 合成生物学 生物安全性 订单请求 多核苷酸 内容描述 能力评估 软件工具 生物安全 新兴科学 有效实践 注释工具 自动注释 构建体 蛋白质 合成 跟踪 帮助 | ||
【主权项】：
1.一种用于提供增强的多核苷酸合成的计算机化系统：a)用于托管数据库的服务器，其中所述数据库适于表示有害生物序列的列表；b)网络连接；以及c)包含用于通用计算机的指令的计算机可读介质，其中所述计算机化系统被配置用于以包括以下步骤的方法操作：i)接收一个或多个设计指令，其中所述设计指令包含多个生物序列，其中每个所述生物序列的长度不超过500个碱基，并且其中所述多个生物序列包括核酸或氨基酸序列；ii)自动确定所述多个生物序列中的至少两个生物序列是否共同对应于所述数据库中的有害生物序列的至少20％；以及iii)如果检测到所述有害生物序列的至少20％，则自动生成警报。
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