[发明专利]用于识别基因表达的条形码在审
| 申请号： | 201780041514.3 | 申请日： | 2017-06-29 |
| 公开（公告）号： | CN109415726A | 公开（公告）日： | 2019-03-01 |
| 发明（设计）人： | K·K·甘贾姆 | 申请（专利权）人： | 微软技术许可有限责任公司 |
| 主分类号： | C12N15/10 | 分类号： | C12N15/10;C12N15/90;C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 北京市金杜律师事务所 11256 | 代理人： | 陈文平;袁元 |
| 地址： | 美国华*** | 国省代码： | 美国;US |
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| 摘要： | 可以通过分析DNA序列来识别基因表达。DNA序列可包含对应于特定基因的条形码序列。条形码序列可以在基因表达期间通过首先将包含条形码序列的同源定向修复(HDR)模板添加到基因的DNA序列中，然后在基因表达期间将条形码序列剪接出RNA前体来产生。由于条形码序列可从RNA前体获得，因此可使用HDR将其添加至DNA链。可以对得到的DNA链进行测序，并且可以分析序列数据以识别DNA序列内的条形码序列，其提供DNA而非RNA中基因的表达的指示。 | ||
| 搜索关键词： | 条形码序列 基因表达 识别基因 基因 剪接 模板添加 序列数据 条形码 测序 同源 分析 修复 | ||
【主权项】：
1.一种方法，其包括：产生第一同源定向修复(HDR)模板，其至少包含第一剪接区域和条形码区域，所述第一剪接区域包含被酶识别以在所述第一剪接区域中产生切口的第一核苷酸序列，并且所述条形码区域包含对应于基因的核苷酸序列；使用HDR将所述第一HDR模板插入所述基因的靶位点中；使用所述酶剪接至少所述第一剪接区域中的所述第一HDR模板以产生第二HDR模板，所述第二HDR模板包含包括所述第一剪接区域的一部分以及所述条形码区域的核苷酸序列；使用HDR将所述第二HDR模板插入双链多核苷酸中；对该另外的双链多核苷酸进行测序以产生测序数据；和至少部分地基于识别所述测序数据中的所述条形码区域的核苷酸序列，确定所述基因已被表达。
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